مقالات

17.4: التحليل الكمي


عندما نعمل مع عدد كبير من المتغيرات التي تصف جوانب بعض الظواهر (مثل العناصر الموجودة في الاختبار كمقاييس متعددة للسمة الأساسية لـ "إتقان الموضوع") ، فإننا غالبًا ما نركز اهتمامنا على ما تتضمنه هذه المقاييس المتعددة " مشترك". باستخدام معلومات حول التباين المشترك بين المقاييس المتعددة ، يمكننا استنتاج البعد أو العامل الأساسي ؛ بمجرد أن نفعل ذلك ، يمكننا تحديد ملاحظاتنا على طول هذا البعد. نهج تحديد أو تسجيل الحالات الفردية من حيث درجاتها على عوامل التباين المشترك بين المؤشرات المتعددة هو هدف تحليل العوامل والمكونات (وبعض تقنيات القياس الأخرى الأقل شيوعًا).

إذا فكرنا في مشكلتنا ذات الوضعين ، فيمكننا تطبيق منطق "القياس" هذا على الممثلين أو على الأحداث. وهذا يعني أنه يمكننا "قياس" أو فهرسة التشابه بين الممثلين من حيث مشاركتهم في الأحداث - لكن وزن الأحداث وفقًا للاختلاف المشترك بينهم. وبالمثل ، يمكننا "قياس" الأحداث من حيث أنماط المشاركة المشتركة للفاعلين - لكن نرجح الفاعلين وفقًا لتكرار حدوثها المشترك. تقنيات مثل أدوات> MDS ويمكن استخدام تحليل العوامل أو المكونات الرئيسية "لقياس" الفاعلين أو الأحداث.

من الممكن أيضًا تطبيق هذه الأنواع من منطق القياس على بيانات الفاعل على حدة. تتضمن UCINET طريقتين لتحليل العوامل المرتبطين ارتباطًا وثيقًا (أدوات> 2-Mode Scaling> SVD و أدوات> 2-Mode Scaling Factor Analysis) التي تدرس التباين المشترك بين كل من الفاعلين والأحداث في وقت واحد. يشمل UCINET أيضًا أدوات> تحجيم ثنائي الوضع> مراسلة الذي يطبق نفس المنطق على البيانات الثنائية. بمجرد تحديد الأبعاد الأساسية للتباين المشترك ، يمكننا بعد ذلك "تعيين" كل من الفاعلين والأحداث في "الفضاء" نفسه. يتيح لنا ذلك معرفة الجهات الفاعلة المتشابهة من حيث مشاركتها في الأحداث (التي تم ترجيحها لتعكس الأنماط الشائعة) ، وما هي الأحداث المتشابهة من حيث ما يشارك فيه الفاعلون (مرجح لتعكس الأنماط الشائعة) ، وأي الفاعلين وتقع الأحداث "قريبة" من بعضها البعض.

من الممكن أحيانًا تفسير العوامل أو الأبعاد الكامنة وراءها لاكتساب نظرة ثاقبة حول سبب تضافر الفاعلين والأحداث معًا بالطرق التي يفعلونها. بشكل أكثر عمومية ، قد تشكل مجموعات الممثلين والأحداث التي تقع بشكل مشابه "أنواعًا" أو "مجالات" ذات معنى من العمل الاجتماعي.

أدناه ، سنقوم بتطبيق هذه الأدوات بإيجاز شديد على البيانات الخاصة بالمانحين الكبار لمبادرات كاليفورنيا في الفترة 2000-2004. هدفنا هو توضيح منطق القياس ثنائي الوضع. المناقشة هنا قصيرة جدًا حول المعالجات التقنية للاختلافات (المهمة) بين التقنيات.

تحليل SVD ثنائي الوضع

يعد تحليل القيمة الفردية (SVD) إحدى طرق تحديد العوامل الكامنة وراء البيانات ذات الوضعين (القيمة). تختلف طريقة استخلاص العوامل (القيم المفردة) إلى حد ما عن تحليل العوامل والمكونات التقليدية ، لذلك من المستحسن فحص كل من نتائج التخصيم في الوضعين SVD و 2.

لتوضيح SVD ، لدينا مدخلات مصفوفة من 23 مانحًا رئيسيًا (أولئك الذين قدموا ما مجموعه أكثر من 1،000،000 دولار أمريكي لخمس حملات أو أكثر) من خلال 44 مبادرة اقتراع في كاليفورنيا. يتم تسجيل كل ممثل على أنه -1 إذا ساهم في معارضة المبادرة ، +1 إذا ساهم لصالح المبادرة ، أو 0 إذا لم يساهم. المصفوفة الناتجة هي بيانات ذات قيمة يمكن فحصها باستخدام SVD وتحليل العوامل ؛ ومع ذلك ، فإن انخفاض عدد المساهمين في العديد من المبادرات ، والتباين المحدود للغاية في المقياس ليسا مثاليين.

يوضح الشكل 17.6 "القيم الفردية" المستخرجة من مصفوفة المستطيلة للمانح على حدة باستخدام أدوات> 2-Mode Scaling> SVD.

شكل 17.6: القياس ثنائي الوضع للمانحين والمبادرات في كاليفورنيا من خلال تحليل القيمة الفردية: القيم الفردية

"القيم المفردة" مماثلة لـ "القيم الذاتية" في تقنيات تحجيم العناصر والمكونات الأكثر شيوعًا. تظهر النتيجة هنا أن "المساحة" المشتركة للتباين بين المانحين والمبادرات لم يتم التقاطها بشكل جيد من خلال التوصيف البسيط. إذا استطعنا بسهولة فهم الأنماط بأفكار مثل "اليسار / اليمين" و "المالي / المعنوي" كأبعاد أساسية ، فلن يكون هناك سوى عدد قليل من القيم الفردية التي تشرح أجزاء كبيرة من التباين المشترك. تخبرنا هذه النتيجة أن الطرق التي "يجتمع بها" الممثلون والأحداث ليست نظيفة وبسيطة وسهلة - في هذه الحالة.

مع وضع هذا التحذير المهم في الاعتبار ، يمكننا فحص كيفية "تحجيم" الأحداث والجهات المانحة أو تحديد موقعها في الأبعاد الأساسية. أولا ، مبادرات الاقتراع. يوضح الشكل 17.7 موقع أو مقياس درجات كل من مقترحات الاقتراع على الأبعاد الستة الأساسية لهذا الفضاء متعدد الأبعاد للغاية.

شكل 17.7: الجهات المانحة والمبادرات SVD لولاية كاليفورنيا: توسيع نطاق المبادرات

اتضح أن البعد الأول يميل إلى تحديد المبادرات الداعمة للإنفاق العام للتعليم والرفاهية الاجتماعية تجاه قطب واحد ، والمبادرات التي تدعم تقييد السلطة التشريعية تجاه الآخر - على الرغم من أن تفسيرات كهذه ذاتية تمامًا. يبدو أن الأبعاد الثانية والأعلى تشير إلى أنه يمكن أيضًا اعتبار المبادرات مختلفة عن بعضها البعض بطرق أخرى.

في الوقت نفسه ، تتيح لنا النتائج تحديد الجهات المانحة أو توسيع نطاقها وفقًا للأبعاد الأساسية نفسها. تظهر هذه التحميلات في الشكل 17.8.

شكل 17.8: الجهات المانحة والمبادرات SVD لولاية كاليفورنيا: توسيع نطاق المانحين

نحو النهاية الإيجابية للبعد الأول (الذي فسرناه سابقًا على أنه لصالح الإنفاق العام) نجد الحزب الديمقراطي ، ونقابات الموظفين العموميين ، ونقابات المعلمين ؛ في القطب المقابل ، نجد الجمهوريين وبعض المجموعات التجارية والمهنية.

غالبًا ما يكون من المفيد تصور مواقع الممثلين والأحداث في مخطط مبعثر محدد بواسطة درجات المقياس على الأبعاد المختلفة. توضح الخريطة في الشكل 17.9 نتائج البعدين الأولين لهذه المساحة.

شكل 17.9: الجهات المانحة والمبادرات SVD في كاليفورنيا: خريطة ثنائية الأبعاد

نلاحظ أن البعد الأول (من اليسار إلى اليمين في الشكل) يبدو أن أقطابه "ترتكز" على الاختلافات بين المبادرات ؛ يبدو أن البعد الثاني (من الأعلى إلى الأسفل) محدد أكثر بالاختلافات بين المجموعات (باستثناء الاقتراح 56). لا تحدد النتيجة بشكل واضح وواضح أحداثًا معينة وفاعلين معينين على طول أبعاد خطية قوية. ومع ذلك ، فإنه ينتج بعض المجموعات المثيرة للاهتمام التي تظهر مجموعات من الجهات الفاعلة جنبًا إلى جنب مع القضايا التي تعتبر مركزية لأنماط مشاركتهم. تجمع الديمقراطيين والنقابات (أعلى اليمين) جنبًا إلى جنب مع عدد من المقترحات الخاصة التي كانوا نشطين للغاية فيها (على سبيل المثال 46 ، 63). مجموعة الشركات والبناء والمشاريع الرأسمالية (بشكل أكثر مرونة) في أسفل اليمين ، جنبًا إلى جنب مع القضايا الأساسية التي شكلت جدول أعمالها الأساسي في عملية المبادرة (على سبيل المثال الدعامة 62).

تحليل عامل ثنائي الوضع

يوفر تحليل العوامل طريقة بديلة لـ SVD لتحقيق نفس الأهداف: تحديد الأبعاد الأساسية للمساحة المشتركة للتباين بين الفاعلين والحدثين ، وتحديد أو تحديد الجهات الفاعلة والأحداث في تلك المساحة. تختلف الطريقة المستخدمة بواسطة تحليل العوامل لتحديد الأبعاد عن طريقة SVD. يوضح الشكل 17.10 القيم الذاتية (حسب المكونات الأساسية) المحسوبة بواسطة أدوات> 2-Mode Scaling> Factor Analysis.

شكل 17.10: القيم الذاتية للعوملة ثنائية النمط للمانحين والمبادرات في كاليفورنيا

هذا الحل ، على الرغم من اختلافه عن SVD ، يشير أيضًا إلى تعقيد كبير في الأبعاد في التباين المشترك بين الفاعلين والأحداث. أي أن التوصيفات البسيطة للأبعاد الأساسية (مثل "اليسار / اليمين") لا توفر تنبؤات دقيقة للغاية حول مواقع الفاعلين أو الأحداث الفردية. طريقة تحليل العامل تنتج تعقيدًا أقل إلى حد ما من SVD.

مع وضع التحذير من الملاءمة الضعيفة لحل منخفض الأبعاد في الاعتبار ، دعنا نفحص مقياس الممثلين في العوامل الثلاثة الأولى (الشكل 17.11)

شكل 17.11: تحميلات المانحين

ينتج العامل الأول ، بهذه الطريقة ، نمطًا مشابهًا لـ SVD. يوجد في أحد القطبين الديمقراطيين والنقابات ، وفي الجانب الآخر توجد العديد من المجموعات الرأسمالية. ومع ذلك ، هناك بعض الاختلافات الملحوظة (مثل AFSCME). يوضح الشكل 17.12 تحميلات الأحداث.

شكل 17.12: تحميل الأحداث

تتشابه الأنماط هنا أيضًا مع نتائج SVD ، ولكنها تختلف اختلافًا كبيرًا في التفاصيل. لتصور الأنماط ، يمكن استخراج عمليات تحميل الممثلين والأحداث على الأبعاد من ملفات بيانات الإخراج ، ورسمها باستخدام مخطط مبعثر.

تحليل المراسلات ثنائية الوضع

بالنسبة للبيانات الثنائية ، لا يوصى باستخدام تحليل العوامل و SVD. تعمل طرق العوملة على مصفوفات التباين / التباين أو الارتباط بين الجهات الفاعلة والأحداث. عندما يتم قياس ارتباطات الجهات الفاعلة بالأحداث على المستوى الثنائي (وهو ما يحدث في كثير من الأحيان في تحليل الشبكة) ، فإن الارتباطات قد تقلل من التباين المشترك وتجعل من الصعب تمييز الأنماط.

كبديل لتحجيم ثنائي الفاعل حسب الحدث ، فإن طريقة تحليل المراسلات (أدوات> تحجيم ثنائي الوضع> مراسلة) يمكن استعماله. يعمل تحليل المراسلات (مثل تحليل الصنف الكامن) على جدولة ثنائية متعددة المتغيرات ، وافتراضات التوزيع الخاصة به مناسبة بشكل أفضل للبيانات الثنائية.

لتوضيح تطبيق تحليل المراسلات ، قمنا بتقسيم بيانات المانح السياسي والمبادرات من خلال تعيين قيمة 1 إذا قدم أحد الفاعلين تبرعًا إما لصالح مبادرة أو ضدها ، وتخصيص صفر إذا لم يشاركوا في الحملة لمبادرة معينة. إذا أردنا أن يركز تحليلنا على الحزبية ، بدلاً من المشاركة البسيطة ، فربما نكون قد أنشأنا مجموعتين من البيانات - واحدة تستند إلى المعارضة أم لا ، والأخرى تستند إلى الدعم أم لا - وقمنا بتحليلين منفصلين للمراسلات.

يوضح الشكل 17.13 موقع الأحداث (المبادرات) على طول ثلاثة أبعاد لمساحة الحدث الفاعل المشترك المحددة بواسطة طريقة تحليل المراسلات.

شكل 17.13: إحداثيات الحدث للمشاركة المشتركة للمانحين في حملات مبادرة كاليفورنيا

نظرًا لأن هذه البيانات لا تعكس الحزبية ، بل المشاركة فقط ، لا نتوقع أن تكون النتائج موازية لتلك التي تمت مناقشتها في الأقسام أعلاه. وهم لا يفعلون ذلك. ومع ذلك ، نرى أنه يمكن استخدام هذه الطريقة أيضًا لتحديد مكان المبادرات على طول أبعاد أساسية متعددة تلتقط التباين في كل من الفاعلين والأحداث. يوضح الشكل 17.14 مقياس الممثلين.

شكل 17.14: ينسق الممثل للمشاركة المشتركة للمانحين في حملات مبادرة كاليفورنيا

البعد الأول هنا لديه بعض التشابه مع القطب الديموقراطي / النقابي مقابل أقطاب الرأسمالية. ومع ذلك ، يعني هذا الاختلاف هنا أن المجموعتين تميلان إلى المشاركة في مجموعات مختلفة من المبادرات ، بدلاً من مواجهة بعضهما البعض في نفس الحملات.

غالبًا ما يكون التصور هو أفضل نهج لإيجاد أنماط ذات مغزى (في غياب نظرية قوية). يوضح الشكل 17.15 مؤامرة الجهات الفاعلة والأحداث في البعدين الأولين لمساحة تحليل المراسلات المشتركة.

شكل 17.15: تحليل المراسلات خريطة ثنائية الأبعاد

يحتوي الربع السفلي الأيمن هنا على مجموعة ذات مغزى من الفاعلين والأحداث ، ويوضح كيف يمكن تفسير نتائج تحليل المراسلات. في أسفل اليمين لدينا بعض المقترحات المتعلقة بمقامرة الكازينو الهندية (68 و 70) واثنين من المقترحات المتعلقة بقضايا البيئة / الحفظ (40 و 50). تم تعيين اثنين من الدول الأمريكية الأصلية الرئيسية (فرق Cahualla و Morongo من Mission Indians) معًا. والنتيجة هي إظهار أن هناك مجموعة من القضايا "التي تحدث بشكل مشترك" مع مجموعة من المانحين - الجهات الفاعلة التي تحدد الأحداث ، والأحداث التي تحدد الجهات الفاعلة.


فهم التحليل النوعي والكمي

في مجال العلاقات العامة والاتصالات ، من الأهمية بمكان استخدام التفكير الكمي والنوعي. ومع ذلك ، غالبًا ما يتم الخلط بين الاثنين. نتيجة لذلك ، يحاول متخصصو العلاقات العامة والاتصالات أحيانًا تعيين تدابير زائفة تعسفية للعمل النوعي (عملية تُعرف باسم "تكوين الأرقام") ، أو محاولة التأثير على التحليل الكمي من خلال وجهات النظر النوعية.

إن الخلط بين أحدهما يقلل بشدة من مصداقية ممارس العلاقات العامة ويقلل من الثقة الممنوحة لنا من قبل المساهمين والمديرين التنفيذيين والعملاء لدينا.

دعونا نفرق بين الاثنين.

التحليل النوعي تعني في الأساس قياس شيء ما بجودته وليس كميته. عندما نقوم بالتحليل النوعي ، فإننا نستكشف كيف نصف شيئًا ما. في كثير من الأحيان ، لا يمكننا استخدام الأرقام أو التعبيرات العددية لوصف هذه الأشياء. عندما نقوم بعمل نوعي ، فإننا نعمل مع الأوصاف. نحن نعمل بالمشاعر والأفكار والتصورات. نحاول فهم الدوافع والسلوكيات.

تحليل كمي هو عكس القياس بالكمية وليس بالجودة. عندما نقوم بالتحليل الكمي ، فإننا نستكشف الحقائق والقياسات والأرقام والنسب المئوية. عندما نقوم بعمل كمي ، فإننا نتعامل مع الأرقام والإحصاءات والصيغ والبيانات.

كل من التحليل النوعي والكمي لهما أهمية حيوية للعلاقات العامة.


17.4: التحليل الكمي

مقياس الطيف الكتلي هو أداة مهمة يستخدمها العديد من العلماء في جميع أنحاء العالم. ومع ذلك ، غالبًا ما تقتصر التعليقات على نقاط القوة والقيود المفروضة على البرامج الحالية على الحكايات بدلاً من الاستفسار الرسمي. على مدار 100 مقابلة حول حالة برمجيات قياس الطيف الكتلي ، اندمجت الأنماط المدهشة في عدة موضوعات: تصور الحدود ، وإدراك جودة البرمجيات ، والاختلافات بين البيئات التجارية وغير الربحية. وعلى وجه الخصوص ، أشارت المقابلات إلى وجود انقسام كبير بين رضا المستخدم عن البرامج الحالية وتصورات المطورين لجودة البرامج. يتم تقديم إجابات العلماء مجهولة المصدر وتلخيصها في اقتراحاتهم لتحسين حالة الفن.

مقالات البحث
توسيع تغطية البروتيوم من خلال الجمع بين طرق MS / MS ومنصة المعلومات الحيوية المعدلة التي تم تكييفها للبحث في قاعدة البيانات عن القطبية الموجبة والسالبة 193 نانومتر أطياف التفكك الضوئي للأشعة فوق البنفسجية
  • سيلفستر إم جرير ،
  • مارشال برن ،
  • كريستوفر بيكر و
  • جينيفر س*

لتوسيع تغطية البروتين التي تم الحصول عليها من مناهج قياس الطيف الكتلي من أسفل إلى أعلى ، يتم استخدام ثلاث طرق تكميلية لتنشيط الأيونات ، وتفكك تصادم الطاقة العالي (HCD) ، والتفكك الضوئي فوق البنفسجي (UVPD) ، والوضع السالب UVPD (NUVPD) ، لاستجواب الببتيدات التجريبية في محللة خلايا الكبد البشرية باستخدام مطياف الكتلة Orbitrap عالي الأداء. يتم تحليل فائدة الجمع بين النتائج من تقنيات التنشيط المتعددة (HCD + UVPD + NUVPD) من أجل العمق الكلي واتساع التغطية البروتينية. تقيس هذه الدراسة أيضًا إصدارًا جديدًا من خوارزمية Byonic ، والتي تم تخصيصها لبحوث قاعدة البيانات لبيانات UVPD و NUVPD. أسفرت عمليات البحث التي تستخدم الخوارزمية المخصصة عن أكثر من 50٪ من تحديدات الببتيد لمجموعات بيانات الببتيد التجريبي UVPD و NUVPD مقارنة بخوارزميات البحث الأخرى. أدى إدراج أطياف UVPD و NUVPD إلى أكثر من 600 تعريف إضافي للبروتين بالنسبة لـ HCD وحده.

Interactome عالي الثقة لـ RNF41 مبني على فحوصات متعامدة متعددة
  • دلفين ماسكاييل ،
  • جوريس وومان
  • جيل فانديمورتيلي ،
  • دلفين دي سوتر ،
  • لينتجي دي كونينك ،
  • سفين ايكرمان* ، و
  • جان تافيرنييه*

بروتين البنصر 41 (RNF41) هو E3 ubiquitin ligase يشارك في تواجد وتدهور العديد من البروتينات بما في ذلك مستقبلات ErbB3 و BIRC6 والباركين. بجانب ذلك ، ينظم RNF41 الاتجار داخل الخلايا لبعض مستقبلات السيتوكينات المرتبطة بـ JAK2 عن طريق انتشار وقمع USP8 ، والذي بدوره يزعزع استقرار مجمع ESCRT-0. لتوضيح وظيفة RNF41 بشكل أكبر ، استخدمنا طرقًا متعامدة مختلفة للكشف عن مركب البروتين RNF41: تنقية التقارب - مطياف الكتلة ، BioID ، و Virotrap. قمنا بدمج هذه النتائج مع مجموعات البيانات المعروفة لـ RNF41 التي تم الحصول عليها باستخدام شاشات microarray MAPPIT و Y2H. بهذه الطريقة ، ننشئ شبكة تفاعلية شاملة عالية الدقة تضم 175 شريكًا بروتينيًا مرشحًا. لإزالة القطع الأثرية المنهجية المحتملة من هذه الشبكة ، قمنا بتقطير البيانات في خريطة تفاعلية عالية الثقة من خلال الاحتفاظ بإجمالي 19 زيارة بروتين محددة في طريقتين أو أكثر من الطرق المتعامدة. تم اختيار AP2S1 ، وهو شريك تفاعل جديد لـ RNF41 ، من هذا التفاعل عالي الثقة لمزيد من التحقق الوظيفي. نكشف عن دور AP2S1 في إشارات مستقبلات اللبتين و LIF ونبين أن RNF41 يستقر وينقل AP2S1.

توصيف التخليق الحيوي لحمض الإندول 3-أسيتيك وتأثيرات هذا الهرمون النباتي على بروتين الميكروب المرتبط بالنبات بانتويا ص. YR343
  • كيسي إستنسون ،
  • جريجوري بي هيرست ،
  • روبرت إف ستاندارت ،
  • العنبر إن الكتاب المقدس ،
  • ديفيد جارسيا
  • كارونا شوري
  • ميتشل جيه دوكتيكز و
  • جينيفر إل موريل فالفي*

يلعب حمض الإندول 3-أسيتيك (IAA) دورًا رئيسيًا في نمو النبات وتطوره ، وتنتج العديد من الميكروبات المرتبطة بالنبات IAA باستخدام التربتوفان كسلعة. باستخدام التحليلات الجينية ، توقعنا أن Pantoea sp. YR343 ، ميكروب معزول من Populus deltoides ، يصنع IAA باستخدام مسار indole-3-pyruvate (IPA). لفهم التخليق الحيوي IAA وتأثيرات التعرض IAA على فسيولوجيا الخلية بشكل أفضل ، قمنا بتمييز بروتينات Pantoea sp. YR343 يزرع في وجود التربتوفان أو IAA. أدى التعرض لـ IAA إلى تنظيم البروتينات التي يُتوقع أن تعمل في نقل الكربوهيدرات والأحماض الأمينية والتخليق الحيوي للسكريات الخارجية (EPS). أظهرت ملامح المستقلب للخلايا من النوع البري إنتاج IPA و IAA و tryptophol ، بما يتوافق مع مسار IPA النشط. أخيرًا ، قمنا ببناء متحولة ΔipdC أظهرت القضاء على التربتوفول ، بما يتوافق مع فقدان نشاط IpdC ، لكننا كنا لا نزال قادرين على إنتاج IAA (20 ٪ من مستويات النوع البري). على الرغم من أننا فشلنا في اكتشاف الوسطاء من مسارات التخليق الحيوي المعروفة لـ IAA ، فإن هذه النتيجة تشير إلى إمكانية وجود مسار بديل أو إنتاج IAA عن طريق مسار غير إنزيمي في Pantoea sp. YR343. كان متحور ΔipdC قادرًا على استعمار الحور بكفاءة ، مما يشير إلى أن مسار IPA النشط غير مطلوب لربط النبات.

علم الأيض يكشف عن تنشيط مستقبلات أريل الهيدروكربونية يؤدي إلى اختلال وظيفي في الكبد والغدة الثديية في التمثيل الغذائي في الفئران المرضعة
  • كيري ر. بيلتون ،
  • يوان تيان
  • ليمين تشانغ ،
  • مالابا أنيثا ،
  • فيليب ب. سميث ،
  • جاري هـ. بيرديو ، و
  • أندرو دي باترسون*

للكبد والغدة الثديية أدوار أيضية تكميلية أثناء الرضاعة. يتم إطلاق الركائز التي يصنعها الكبد في الدورة الدموية ويتم تناولها بواسطة الغدة الثديية لإنتاج الحليب.تم تحديد مستقبل أريل الهيدروكربون (AHR) كمنظم للإرضاع في الفئران ، وقد ارتبط تنشيطه بعدد لا يحصى من العيوب المورفولوجية والجزيئية والوظيفية مثل توقف نمو الغدة ، وانخفاض إنتاج الحليب ، والتغيرات في التعبير الجيني. في هذه الدراسة ، حددنا التغيرات الأيضية الضارة في شبكة الرضاعة (الثديية والكبد والمصل) المرتبطة بتنشيط AHR باستخدام المستقلبات القائمة على الرنين المغناطيسي النووي (NMR). تم تغذية الفئران الحامل التي تعبر عن Ahrd (تقارب منخفض) أو Ahrb (عالية التقارب) على وجبات تحتوي على بيتا نافثوفلافون (BNF) ، وهو ناهض قوي لـ AHR. حدد تحليل التمثيل الغذائي للثدي والمصل والكبد تغيرات مهمة في الدهون الوسيطة ودورة TCA في فئران Ahrb. لاحظنا انخفاض مستويات الأحماض الأمينية والجلوكوز في مستخلصات الغدة الثديية لفئران Ahrb التي تغذت على BNF. كان لمصل فئران BNF التي تتغذى على Ahrb تغيرات كبيرة في LDL / VLDL (زيادة) و HDL و PC و GPC (انخفض). كشف تحليل PCR الكمي عن انخفاض بنسبة 50٪ في التعبير عن الجينات الرئيسية لتكوين اللاكتوز في الثدي بما في ذلك بروتين مصل اللبن و α-lactalbumin و β-casin لاحظنا أيضًا اضطرابات مورفولوجية ونمائية في الغدة الثديية تتوافق مع التقارير السابقة. تدعم ملاحظاتنا أن نشاط AHR يساهم في تنظيم التمثيل الغذائي في شبكة الإرضاع.

تحديد أولويات البروتين المنتظم لدراسات البروتينات المستهدفة من خلال تعدين الأدب
  • كون شينغ يو ،
  • تسونغ-لو مايكل لي ،
  • تشي شيانغ وانغ ،
  • يو جو تشين ،
  • كريستوفر ري ،
  • صامويل سي كو ،
  • جونغ هسين شيانغ* ,
  • إسحاق س. كوهين* ، و
  • مايكل سنايدر*

هناك أكثر من 3.7 مليون مقال منشور حول الوظائف البيولوجية أو الآثار المرضية للبروتينات ، مما يشكل مصدرًا مهمًا لمعرفة البروتينات. ومع ذلك ، من الصعب تلخيص الملايين من نتائج البروتينات في الأدبيات يدويًا وتحديد مدى صلتها بالبيولوجيا والأمراض موضع الاهتمام. قمنا بتطوير إطار عمل مؤتمت بالكامل للمعلومات الحيوية لتحديد البروتينات المرتبطة بأي كيان بيولوجي وتحديد أولوياتها. استخدمنا 22 منطقة مستهدفة من مشروع البروتينات البشرية (B / D) المدفوع بالأمراض (B / D) كأمثلة ، وأعطينا الأولوية للبروتينات ذات الصلة من خلال نتائج محرك البحث العالمي المنشأ (PURPOSE) الخاص بهم من النتيجة من خلال مقارنة نتائج ترتيب أولويات البروتين بقاعدة بيانات منسقة ، وحساب عشرات البروتينات عبر موضوعات B / D-HPP ، وميزت البروتينات العليا في الكائنات الحية النموذجية الشائعة. قمنا أيضًا بتوسيع سير عمل المعلوماتية الحيوية لتحديد البروتينات ذات الصلة في جميع أنظمة الأعضاء والأمراض البشرية ونشرنا أداة قائمة على السحابة لتحديد أولويات البروتينات المتعلقة بأي مصطلحات بحث مخصصة في الوقت الفعلي. يمكن أن تسهل أداتنا تحديد أولويات البروتينات لأي نظام عضو أو مرض مهم ويمكن أن تساهم في تطوير الدراسات البروتينية المستهدفة للطب الدقيق.

الببتيدوميات التفاضلية المستحثة بالتزاوج من الببتيدات العصبية وهرمونات البروتين في أجروتيس إبسيلون العث
  • ماكس ديسنر ،
  • أورور جالوت ،
  • هيلينا بينز ،
  • سيريل جارتنر
  • سايمون فيتسيك ،
  • يورغ كاهنت ،
  • يواكيم شاتنر
  • ايمانويل جاكين جولي و
  • كريستوف جادن*

في العديد من الحشرات ، يؤدي التزاوج إلى تغييرات جذرية في استجابات الذكور والإناث للفيرومونات الجنسية أو روائح النبات المضيف. في ذكور العثة Agrotis ipsilon ، يؤدي التزاوج إلى تثبيط عابر للاستجابات السلوكية والعصبية لفرمون الجنس الأنثوي. نظرًا لأن الببتيدات العصبية وهرمونات الببتيد تنظم معظم العمليات السلوكية ، فإننا نفترض أنها يمكن أن تشارك في هذه اللدونة الشمية المعتمدة على التزاوج. استخدمنا هنا تسلسل الحمض النووي الريبي من الجيل التالي ومزيجًا من الكروماتوغرافيا السائلة ، وطيف كتلة التأين بمساعدة المصفوفة بالليزر (MALDI-TOF) ، وتنميط الأنسجة المباشر لتحليل النسخ والببتيدوم لمقصورات الدماغ المختلفة في عذراء و تزاوج الذكور والإناث من A. ipsilon. حددنا 37 نسخة ترميز سلائف الببتيد العصبي المفترضة و 54 ببتيدًا عصبيًا مفترضًا نشطًا بيولوجيًا من 23 سلائف ببتيد عصبي (70 تسلسلًا في المجموع ، 25 سلائف ببتيد عصبي) في مناطق مختلفة من الجهاز العصبي المركزي بما في ذلك فصوص الهوائيات ، والعقدة النثوية ، والجسم القلبية. مجمع allata. كشفت المقارنات بين الذكور والإناث البكر والمتزاوج عن اختلافات في الأنسجة في تكوين الببتيد بين الجنسين ووفقًا للحالة الفسيولوجية. أظهر الذكور المتزاوجون اختلافات بعد التزاوج في حدوث الببتيد العصبي ، والتي يمكن أن تشارك في اللدونة الشمية التي يسببها التزاوج.

حذف الدهون الثلاثية الدهنية ليباز يربط تراكم ثلاثي الجليسيرول بنمط ظاهري أكثر عدوانية في خلايا سرطان الرئة A549
  • تمارا تومين ،
  • كاتارينا فريتز
  • يورجن جيندلهوبر ،
  • ليندا فالدير ،
  • بيتينا بوتشر ،
  • جيرهارد ج.
  • دانيال كي نومورا ،
  • ماتياس شيتماير و
  • روث بيرنر جروينبيرجر*

يحفز ليباز الدهون الثلاثية الدهنية (ATGL) خطوة الحد من المعدل في انهيار ثلاثي الجلسرين في الخلايا الشحمية ولكن يتم التعبير عنه في معظم الأنسجة. تبين أن الإنزيم يضيع في العديد من الأورام البشرية ، وقد يلعب فقدانه دورًا في المراحل المبكرة من تطور السرطان. هنا ، أبلغنا أن فقدان ATGL يدعم النمط الظاهري للسرطان الأكثر عدوانية في نظام نموذجي تم فيه حذف ATGL في خلايا سرطان الرئة A549 بواسطة CRISPR / Cas9. لاحظنا أن فقدان ATGL أدى إلى تراكم ثلاثي الجلسرين في قطرات الدهون ومستويات أعلى من الفوسفوليبيد الخلوي وأنواع الدهون النشطة بيولوجيًا (الليزوز والأثير- الفوسفوليبيد). كشفت البروتينات الكمية الخالية من الملصقات عن تعبير مرتفع عن كيناز SRC المؤيد للورم في الخلايا المستنفدة ATGL ، والذي تم العثور عليه أيضًا على مستوى mRNA وتم تأكيده على مستوى البروتين بواسطة لطخة غربية. باستمرار ، لوحظ تعبير أعلى من SRC (النشط) الفسفوري (Y416 phospho-SRC) في خلايا ATGL-KO. تم ترحيل الخلايا المستنفدة من ATGL بشكل أسرع ، والتي كانت تعتمد على نشاط كيناز SRC. نقترح أن فقدان ATGL قد يزيد بالتالي من عدوانية السرطان عن طريق تنشيط الإشارات المؤيدة للأورام عبر SRC كيناز وزيادة مستويات الدهون النشطة بيولوجيًا.

التقييم المنهجي لاستخدام المصل والبلازما البشرية لبروتيوميات البندقية القائمة على قياس الطيف الكتلي
  • جياي لان ،
  • أنطونيو نونيز جاليندو ،
  • جيمس دويكي ،
  • كريستوفر فاولر
  • رالف ن.مارتينز ،
  • ستيفاني ر.ريني سميث ،
  • Ornella Cominetti و
  • لويك دايون*

على مدى العقدين الماضيين ، تم استخدام EDTA-plasma كمصفوفة عينة مفضلة لتشخيص بروتين الدم البشري. كما تم استخدام المصل على نطاق واسع. قيمت دراسات قليلة فقط الفرق وأهمية الملامح البروتينية التي تم الحصول عليها من عينات البلازما ، مثل EDTA- بلازما أو الليثيوم-هيبارين- بلازما ، والمصل. إن إجراء تقييم أكثر اكتمالاً لاستخدام EDTA- بلازما ، وبلازما الهيبارين ، والمصل من شأنه أن يوسع إلى حد كبير شمولية بروتينات بندقية الصيد لعينات الدم. في هذه الدراسة ، قمنا بتقييم استخدام بلازما الهيبارين فيما يتعلق ببلازما EDTA والمصل لتوصيف بروتينات الدم باستخدام خط أنابيب بروتيني آلي قابل للتطوير (ASAP2). تم اختبار استخدام البلازما والمصل لبروتينات البندقية القائمة على مقياس الطيف الكتلي لأول مرة باستخدام عينات مجمعة تجارية. تمت مقارنة تناسق التغطية البروتينية والأداء الكمي. علاوة على ذلك ، تمت دراسة قياسات البروتين في عينات EDTA-plasma و heparin-plasma بشكل مقارن باستخدام أزواج العينات المتطابقة من 20 فردًا من الدراسة الأسترالية للتصوير والعلامات الحيوية ونمط الحياة (AIBL). حددنا 442 بروتينًا مشتركًا بين عينات بلازما EDTA وعينات بلازما الهيبارين. أظهر الاتفاق العام للتقدير الكمي النسبي للبروتين بين أزواج العينات أن بروتينات البندقية باستخدام تدفقات العمل مثل ASAP2 مناسبة في تحليل بلازما الهيبارين وأن هذا النوع من العينات يمكن اعتباره في دراسات الأبحاث السريرية واسعة النطاق. علاوة على ذلك ، أظهرت تداخلات التغطية الجزئية للبروتين (على سبيل المثال ، 70٪) أن القياسات من بلازما الهيبارين يمكن أن تكون مكملة لتلك التي تم الحصول عليها من EDTA- بلازما.

أول مقارنة بين بروتين الخلية الكاملة والليسين أسيتيلوم Trichophyton rubrum مراحل Conidial و Mycelial
  • Xingye Xu ،
  • تاو ليو
  • جيان يانغ
  • Lihong Chen ،
  • بو ليو ،
  • لينجلينج وانج و
  • تشي جين*

Trichophyton rubrum هو أكثر مسببات الأمراض الفطرية شيوعًا في العالم ، والذي تمت دراسته على أنه كائن حي نموذجي هام للفطر الجلدي. على الرغم من انتشار T. rubrum ، فإن العلاجات المتاحة المضادة للفطريات ليست فعالة بما فيه الكفاية. في هذه الدراسة ، أجرينا المقارنة الأولى بين مرحلتي النمو الرئيسيتين لـ T. rubrum: مرحلتي Conidial و mycelial ، بناءً على بروتينات الخلية الكاملة و lysine acetylomes. في المجموع ، تم تحديد 4343 بروتينًا في كلتا المرحلتين ، وتم تحديد 1879 بروتينًا على أنها معبرة بشكل تفاضلي بين المرحلتين. أظهرت النتائج أن البروتياز الإفرازي كان أكثر وفرة في الكونيديا ، بينما تم تنشيط الأيض الهوائي وتخليق البروتين بشكل كبير في المرحلة الفطرية. بالإضافة إلى ذلك ، تم تحديد 386 موقعًا أسيتيلًا على 285 بروتينًا و 5414 موقعًا أسيتيلًا على 2335 بروتينًا في الكونيديا والميسليا ، على التوالي. شاركت تعديلات الأسيتيل بشكل كبير في عملية التمثيل الغذائي وتخليق البروتين في كلتا المرحلتين ولكنها تشارك بشكل مختلف في موسوعة كيوتو لمسارات الجينات والجينوم وفي التنظيم اللاجيني بين المرحلتين. علاوة على ذلك ، فإن تثبيط الأسيتيل ترانسفيرازات أو ديستيلازات يثبط بشكل كبير نمو الفطريات ويحدث موت الخلايا المبرمج ستعمل هذه النتائج على تعزيز فهمنا للخصائص البيولوجية والفسيولوجية لـ T. rubrum وتسهيل تطوير العلاجات المحسّنة التي تستهدف هذه الفطريات المسببة للأمراض ذات الأهمية الطبية.

الملامح الأيضية المتعلقة بالسمنة والتمييز للسمنة غير الصحية الأيضية
  • مينو باقري
  • فرشاد فرزفار
  • لو تشي ،
  • مير سعيد يكنينجاد
  • مريم شماري
  • Oana A. Zeleznik ،
  • زهرة كلنتار
  • زارين إبراهيمي
  • علي شيدعي
  • بيرتهولد كوليتزكو ،
  • أولاف أول ، و
  • أبو القاسم الجزيري*

مجموعة فرعية معينة من البالغين الذين يعانون من السمنة المفرطة ، والتي تعتبر سمنة صحية التمثيل الغذائي (MHO) ، لديها مخاطر أقل من مضاعفات التمثيل الغذائي. ومع ذلك ، فإن الأساس الجزيئي الذي يساهم في هذا النمط الظاهري الصحي لا يزال غير واضح. كان الهدف من هذا العمل هو تحديد أنماط الأيض المرتبطة بالسمنة التي تختلف بين مجموعات MHO ومجموعات السمنة غير الصحية الأيضية (MUHO) وفحص ما إذا كانت هذه الأنماط مرتبطة بتطور اضطرابات استقلاب القلب في عينة من السكان البالغين الإيرانيين الذين تتراوح أعمارهم بين 18 و 50 عامًا. تم تعريف المستقلبات الصالحة على أنها نواتج أيضية اجتازت تحليل مراقبة الجودة للدراسة. في دراسة الحالة والشواهد هذه ، تمت مقارنة 104 مستقلبات صالحة لـ 107 MHO و 100 MUHO بشكل منفصل مع 78 من البالغين ذوي الوزن الطبيعي الأصحاء (NWMH). تم استخدام الانحدار الخطي متعدد المتغيرات للتحقيق في جميع العلاقات المحتملة في الدراسة. تم استخدام نهج أيضي مستهدف باستخدام كروماتوجرافيا سائلة مقترنة بمطياف كتلة ثلاثي رباعي الأضلاع لتشكيل مستقلبات البلازما. كشفت الدراسة أنه بعد تصحيح Bonferroni ، كانت الأحماض الأمينية ذات السلسلة المتفرعة ، والتيروزين ، وحمض الجلوتاميك ، و diacyl-phosphatidylcholines C32: 1 و C38: 3 مباشرة و acyl-carnitine C18: 2 ، و acyl-lysophosphatidylcholines C18: 1 و C18: 2 ، و alkyl-lysophosphatidylcholines C18.0 ارتبطت عكسياً مع النمط الظاهري MHO. لوحظت نفس الأنماط في مرضى MUHO باستثناء ملامح أسيل كارنيتين وليزوفوسفاتيديل كولين حيث كان أسيل كارنيتين C3: 0 وأسيل ليسوفوسفاتيديل كولين C16: 1 أعلى وكان أسيل ليسوفوسفاتيديل كولين C18: 1 ، C18: 2 أقل في هذا النمط الظاهري. علاوة على ذلك ، تم ربط البرولين و diacyl-phosphatidylcholines C32: 2 و C34: 2 ارتباطًا سلبيًا بمجموعة MUHO والسيرين والأسباراجين وأسيل ألكيل فوسفاتيديل كولين C34: 3. كانت العوامل المكونة من الأحماض الأمينية مباشرة وكانت تلك التي تحتوي على ليسوفوسفاتيديل كولين مرتبطة بشكل عكسي بالعلامات الحيوية القلبية في كلا الطرز الظاهرية. ومن المثير للاهتمام أن العامل المحتوي على diacyl-phosphatidylcholines كان مرتبطًا ارتباطًا مباشرًا باضطرابات القلب في مجموعة MUHO. قد يساعد نمط معين من الأحماض الأمينية والفوسفوليبيدات المحتوية على الكولين في تحديد صحة التمثيل الغذائي بين مرضى السمنة.

Neuropeptidomics من نوى الفئران Habenular
  • نينغ يانغ
  • كريشنا د.ب.أنابيندي ،
  • ستانيسلاف س. روباخين ،
  • بينجلي وي ،
  • تشينغ يو ،
  • Lingjun Li ،
  • بول جيه كيني ، و
  • جوناثان ف.سويدلر*

تُحفظ النوى الحبيبية عبر الفقاريات ، وهي عبارة عن زوج من الهياكل المتناظرة الصغيرة في المهاد. تربط النوى وظيفيًا الدماغ الأمامي والدماغ المتوسط ​​من خلال تلقي المدخلات من عدة مناطق بالمخ وإسقاطها. تتكون كل نواة حبيبية من نواتين رئيسيتين غير متناظرتين ، وهما العنب الإنسي والجانبي. ترتبط هذه النوى الفرعية بعمليات واضطرابات فسيولوجية مختلفة ، مثل الاكتئاب وإدمان النيكوتين وترميز المنبهات البغيضة أو حذف المنبهات المجزية المتوقعة. يتطلب توضيح وظائف النوى الحبيبية على المستوى الجزيئي معرفة مكمل الببتيد العصبي. في هذا العمل ، ثلاث تقنيات لقياس الطيف الكتلي (MS) - الكروماتوغرافيا السائلة (LC) المقترنة بـ Orbitrap الترادفي MS (MS / MS) ، LC المقترنة بتحويل فورييه (FT) - الرنين الأيوني (ICR) MS / MS ، والمصفوفة- تم استخدام تقنية امتصاص / تأين الليزر المساعد (MALDI) FT-ICR MS - للكشف عن ملامح الببتيد العصبي لحبل القوارض الإنسي والجانبي. بمساعدة تثبيت الأنسجة والمعلوماتية الحيوية ، تم اكتشاف ما مجموعه 262 و 177 ببتيدًا عصبيًا منتَجًا من 27 و 20 بروهورمونًا من منطقتي حبنيولا الإنسي والجانبي ، على التوالي. من بين هذه الببتيدات العصبية ، تم العثور على 136 حصريًا في الحاجز الإنسي ، وتم التعبير عن 51 حصريًا في العنب الجانبي. بالإضافة إلى ذلك ، تم تحديد مواقع جديدة من الكبريتات ، وهو تعديل نادر بعد الترجمة ، على هرمون سيكروغرانين I prohormone. توضح النتائج أن هاتين النويتين الصغيرتين للدماغ تحتويان على ذخيرة ثرية ومتباينة من الببتيد ، حيث تتيح هذه المعلومات مجموعة من دراسات المتابعة.

يكشف التحليل البيني لبروتين NS1 المشفر بواسطة فيروس الأنفلونزا A H7N9 عن دور مثبط لـ NS1 في نضوج mRNA المضيف
  • ري لين كو ،
  • تشي جين تشين
  • إي هونغ تام ،
  • تشونغ جوي هوانغ ،
  • لي هسين لي ،
  • زونغ هوا لي ،
  • بي تشيا سو ،
  • هاو بينغ ليو و
  • تشيه تشينغ وو*

يمكن أن تؤدي عدوى فيروس الأنفلونزا أ إلى أمراض الجهاز التنفسي الحادة. ينتقل النوع الفرعي H7N9 من فيروس إنفلونزا الطيور A إلى البشر ويسبب المرض الشديد والوفاة. البروتين غير البنيوي 1 (NS1) لفيروس الأنفلونزا أ هو أحد العوامل المؤثرة في الضراوة أثناء العدوى الفيروسية. لتوضيح وظائف NS1 المشفرة بواسطة فيروس الأنفلونزا A H7N9 (H7N9 NS1) ، تم تحديد شركاء التفاعل لـ H7N9 NS1 في الخلايا البشرية من خلال الترسيب المناعي متبوعًا بـ SDS-PAGE مقترنًا بالكروماتوجرافيا السائلة - قياس الطيف الكتلي الترادفي (GeLC-MS / MS) . حددنا 36 بروتينًا خلويًا كشركاء متفاعلين لـ H7N9 NS1 ، وهم يشاركون في معالجة الحمض النووي الريبي ، وربط الرنا المرسال عبر spliceosome ، ومسار مراقبة الرنا المرسال. تم تأكيد تفاعل اثنين من الشركاء المتفاعلين ، الوحدة الفرعية 2 (CPSF2) و CPSF7 ، وهما الانقسام وخصوصية عامل البولي أدينيل مع H7N9 NS1 باستخدام الترسيب المناعي المشترك والتكتل المناعي استنادًا إلى الاكتشاف السابق الذي يشير إلى أن البروتينين متورطان في آلية تفاعل البولي أدينيل قبل الرنا المرسال. علاوة على ذلك ، نوضح أن الإفراط في التعبير عن H7N9 NS1 ، وكذلك العدوى بفيروس الأنفلونزا A H7N9 ، يتداخلان مع polyadenylation pre-mRNA في الخلايا المضيفة. حددت هذه الدراسة بشكل شامل تفاعل H7N9 NS1 في الخلايا المضيفة ، وأظهرت النتائج نمطًا داخليًا جديدًا لـ H7N9 NS1 في تثبيط نضج الرنا المرسال للمضيف.

يتكرر التعرف البروتيني للبروتينات التي يسببها الإنترفيرون مع ببتيد رباعي الببتيد كعلامات لاستقطاب M1 البلاعم
  • تشينغ هوانغ ،
  • كيتلين لويس
  • ناتالي أ. بورغ ،
  • قنوات Meritxell ،
  • هنري ديب ،
  • جرانت آر دروموند ،
  • روبرت جود ،
  • رالف ب.
  • أنتوني فينه ،
  • مينجيو تشو ،
  • باربرا كيمب هاربر* ,
  • عوديد كليفيلد* ، و
  • مارتن جيه ستون*

قد يتم استقطاب البلاعم ، التي تتراكم في الأنسجة أثناء الالتهاب ، نحو أنماط ظاهرية مؤيدة للالتهابات (M1) أو نماذج تعويضية للأنسجة (M2) يمكن أن يكون للتوازن بين هذه الأنماط تأثير كبير على نتائج الأمراض الالتهابية مثل تصلب الشرايين. قد تكون المؤشرات الحيوية المحسنة للبلاعم M1 و M2 مفيدة للبحث والتشخيص ومراقبة آثار العلاجات التجريبية في مثل هذه الأمراض. لتحديد المؤشرات الحيوية الجديدة ، قمنا بتمييز البروتينات العالمية للبروتينات الضامة THP-1 المستقطبة لحالات M1 و M2 مقارنة بالضامة غير المستقطبة (M0). أدى استقطاب M1 إلى زيادة التعبير عن العديد من البروتينات المؤيدة للالتهابات بما في ذلك منتجات 31 جينًا تحت التحكم النسخي لعامل تنظيم الإنترفيرون 1 (IRF-1). في المقابل ، حدد استقطاب M2 البروتينات التي تنظمها مكونات عامل النسخ AP-1. من بين البروتينات الأكثر تنظيمًا في ظل ظروف M1 كانت البروتينات الثلاثة التي يسببها الإنترفيرون مع تكرار رباعي الببتيد (IFITs: IFIT1 و IFIT2 و IFIT3) ، والتي تعمل في الدفاع المضاد للفيروسات. علاوة على ذلك ، تم تنظيم IFIT1 و IFIT2 و IFIT3 mRNA بقوة في الضامة الأولية البشرية المستقطبة M1 وتم التعبير عن IFIT1 أيضًا في مجموعة فرعية من الضامة في أقسام الشريان الأبهر والشريان العضدي من تصلب الشرايين ApoE - / - الفئران. على أساس هذه النتائج ، نقترح أن IFITs قد تكون بمثابة علامات مفيدة لتصلب الشرايين والأمراض الالتهابية الأخرى المحتملة.

الأيض المستهدف يكشف عن دور وقائي لـ PPARα القاعدية في الركود الصفراوي الناجم عن α-Naphthylisothiocyanate
  • مانيون داي ،
  • هويينج هوا ،
  • هانت لين ،
  • جانجمينج شو ،
  • شياووي هو ،
  • فاي لي ،
  • فرانك ج. جونزاليس
  • ايمينغ ليو* ، و
  • جولين يانغ*

α-Naphthylisothiocyanate (ANIT) هو عامل تجريبي يستخدم للحث على ركود صفراوي داخل الكبد. يتم استخدام خط الماوس Ppara-null على نطاق واسع لاستكشاف الأدوار الفسيولوجية والمرضية لـ PPARα. ومع ذلك ، لا يُعرف الكثير عن كيفية تأثير PPARα على السمية الكبدية لـ ANIT. في هذه الدراسة ، تم علاج الفئران من النوع البري و Ppara-null عن طريق الفم باستخدام ANIT للحث على الركود الصفراوي. مستقلب مصل الفئران من النوع البري مفصول عن الفئران الخالية من Ppara ، مدفوعة بالتغيرات في مستقلبات حمض الصفراء (BA). تم رفع الفوسفاتاز القلوي وإجمالي BAs بشكل تفضيلي في الفئران الخالية من Ppara ، والتي ارتبطت بالتغيرات في Cyp7a1 و Cyp8b1 و Mrp3 و Cyp3a11 و Cyp2b10 و Ugt1a2 و Ugt1a5 وأظهرت تداخلًا بين الجينات القاعدية PPARα والمسارات التكيفية المحتملة.تم تنظيم الجينات Il6 و Tnfa والجينات المستهدفة في مسار STAT3 (Socs3 و Fga و Fgb و Fgg) في فئران Ppara-null ولكن ليس في الفئران من النوع البري. تم تنشيط مسار JNK في كلا سطري الماوس ، بينما تم تنشيط NF-B و STAT3 فقط في الفئران الخالية من Ppara. تشير هذه البيانات إلى الحماية من الركود الصفراوي بواسطة PPARα القاعدية التي تتضمن تنظيم استقلاب BA وتثبيط إشارات NF-B / STAT3. بالنظر إلى الدراسات حول التأثيرات الوقائية لكل من PPARα الأساسي والمنشط ، يجب توخي الحذر عندما يحاول المرء استخلاص استنتاجات يتم فيها تعديل PPARα عن طريق التلاعب الجيني أو الصيام أو التنشيط في الدراسات الدوائية والسمية.

تكشف التحليلات البروتينية والكيميائية الحيوية عن آلية جديدة لتعزيز انتشار البروتين وتدهوره بواسطة UFBP1 ، وهو مكون رئيسي من Ufmylation
  • ينغ تشو ،
  • تشينغ لي ،
  • دان لي ،
  • يانغ زانغ ،
  • شياوجانغ جيانغ
  • Zhanhong Hu و
  • Guoqiang Xu*

ينظم التعديل اللاحق للبروتين بواسطة معدل طيات اليوبيكويتين 1 ، UFM1 ، العديد من العمليات البيولوجية مثل الاستجابة لإجهاد الشبكة الإندوبلازمية وتنظيم تطور الورم. أشارت دراسة حديثة إلى أن البروتين 1 المرتبط بمجال UFM1 و PCI المحتوي على المجال (UFBP1) مطلوب لاقتران UFM1 إلى ركيزة. ومع ذلك ، لم يتم استكشاف الوظائف البيولوجية الأخرى لـ UFBP1. هنا ، نستخدم الترسيب المناعي والبروتينات الكمية الخالية من الملصقات لتحديد البروتينات المتفاعلة مع UFBP1 في خط خلية الثدييات. يتم الحصول على حوالي 80 بروتينًا متفاعلًا محتملًا من تحليلات MS لثلاث مكررات بيولوجية. تشير تحليلات المعلوماتية الحيوية لهذه البروتينات إلى أن UFBP1 قد يشارك في تنظيم طي البروتين واستقراره وتهريبه. تكتشف التجارب البيوكيميائية أن تعبير UFBP1 يقلل من مستوى البروتين ويقلل من استقرار العديد من البروتينات المتفاعلة ، بينما تزيد ضربة قاضية لـ UFBP1 من مستويات البروتين. تُظهر تجارب تثبيط تخليق البروتين وتثبيط البروتوزومات أن UFBP1 يعزز انتشارها وتدهورها. أثبتت التجارب باستخدام بروتين ANT3 المتفاعل مع UFBP1 أن UFBP1 يعزز التفاعل بين ANT3 و E3 ligase وبالتالي يعزز انتشاره وتدهوره. يوضح عملنا آلية جزيئية جديدة ينظم من خلالها UFBP1 انتشار البروتين وتدهوره.

تطوير وتوحيد بروتوكول للرنين المغناطيسي النووي الكمي للبروتونات (1 H NMR) مطيافية اللعاب
  • الكسندر جاردنر ،
  • هارولد جي باركس ،
  • جاي إتش كاربنتر ، و
  • بو واه سو*

التنميط الأيضي بواسطة مطيافية H NMR هي تقنية غير مستغلة بشكل كاف في أبحاث اللعاب ، على الرغم من أن الدراسات الأولية قد حددت نتائج واعدة في مجالات متعددة (التشخيص والتغذية وعلم وظائف الأعضاء الرياضي). يتم إعاقة ترجمة النتائج الأولية إلى معرفة تم التحقق من صحتها ومعتمدة سريريًا بسبب التباين في بروتوكول جمع اللعاب وتخزينه وإعداده وتحليله. تهدف هذه الدراسة إلى تقييم آثار المعالجات المختلفة للعينة على ملف التمثيل الغذائي 1H NMR للعاب. تتنوع اعتبارات البروتوكول بشكل كبير في قاعدة الأدبيات الحالية ، بما في ذلك الطرد المركزي ودورات التجميد والذوبان وطرق مختلفة لتقدير الرنين المغناطيسي النووي. تشير النتائج التي توصلنا إليها إلى أن ملف مستقلب 1H NMR للعاب مرن لأي تغيير ناتج عن التجميد ، بما في ذلك تجميد اللعاب قبل الطرد المركزي. ومع ذلك ، كان الطرد المركزي ضروريًا لإزالة ذروة عريضة غير محددة بين 1.24 و 1.3 جزء في المليون ، والتي ترتبط شدتها بشدة بالمحتوى الخلوي اللعابي. حجبت هذه الذروة ذروة الميثيل من اللاكتات وأثرت بشكل كبير على القياس الكمي. كان تقدير كمية المستقلب مشابهًا للطرد المركزي للعاب بين 750 جم إلى 15000 جم. كان القياس الكمي للمستقلبات اللعابية متشابهًا سواء تم قياسه باستخدام الفوسفات الداخلي المخزن بالفوسفات الصوديوم ثلاثي ميثيل سيليل- [2،2،3،3-2H4] بروبيونات (TSP) أو TSP خارجي في أنبوب NMR متحد المحور يوضع داخل أنبوب الرنين المغناطيسي النووي الذي يحتوي على عينة اللعاب. تشير نتائجنا إلى أن الأدبيات الحالية حول اللعاب 1H NMR لن تتأثر سلبًا بالاختلافات في البروتوكول المشترك ، ومع ذلك ، يبدو أن استخدام TSP كمعيار داخلي بدون وسيط مخزّن يؤثر على تقدير كمية المستقلب ، لا سيما للأسيتات والميثانول. نقوم بتضمين توصيات البروتوكول لتسهيل دراسات اللعاب المستندة إلى الرنين المغناطيسي النووي في المستقبل.

تكشف البروتينات الكمية وعلم الخلايا في المجالات الغشائية الغنية بحبوب لقاح الأرز عن إشارات قطبية الخلية المحددة مسبقًا في حبوب اللقاح الناضجة

قطبية الخلية ضرورية لتوليد وظائف خلوية متنوعة. الآليات الأساسية لكيفية إنشاء الخلية والحفاظ عليها وتغييرها قطبية غير مفهومة جيدًا. في الآونة الأخيرة ، وجد أن المجالات الدقيقة الغشائية الغنية بالستيرول مرتبطة بهذه العمليات. ومع ذلك ، لا تزال خصائصها الدقيقة وأهميتها غير واضحة. نعرض هنا نطاقات صغيرة تتغير ديناميكيًا في تطوير وإنبات حبوب لقاح الأرز بإثراء انتقائي في الفتحة وطرف أنابيب حبوب اللقاح المولودة حديثًا باستخدام مسبار فلبيني خاص بالستيرول. باستخدام حساسيات استخراج الستيرول لبروتينات المجال الصغير والبروتينات الكمية ، حددنا 237 بروتينًا مرتبطًا بالنطاق الجزئي من 934 بروتينًا غشائيًا مقاومًا لحبوب اللقاح تم تحديده. يشتمل هذا البروتين تقريبًا على جميع المنظمين الرئيسيين المعروفين الذين يتألفون من شبكة النمو القطبية ، ويظهر تشابهًا أكبر مع خلايا هيلا المستقطبة الأمامية والخلفية مقارنة بخلايا أرابيدوبسيس المعلقة غير المستقطبة. نحن نحدد البروتين الشبيه بالفلوتيلين المناعي ، وهو ممثل لهذه البروتينات المعتمدة على الستيرول ونتصور النطاقات الدقيقة في حبوب اللقاح مباشرة. تشير هذه النتائج إلى وجود نطاقات دقيقة في حبوب اللقاح وقطبية خلوية محددة مسبقًا حول الفتحة أثناء نضوج حبوب اللقاح. تكشف النتائج التي توصلنا إليها عن أطلس للبروتين المرتبط بالنطاق الصغير في حبوب اللقاح. يوفر هذا العمل الموارد والمعرفة المفيدة اللازمة لمزيد من تشريح آليات إنشاء وصيانة قطبية الخلية.

PACOM: أداة متعددة الاستخدامات لدمج وتصفية وتصور ومقارنة مجموعات بيانات بروتيوميات قياس الطيف الكتلي الكبير
  • سلفادور مارتينيز بارتولومي ،
  • ألبرتو مدينا أونون ،
  • ميغيل أنخيل لوبيز غارسيا
  • كارمن غونزاليس تيجيدو ،
  • جوركا برييتو ،
  • روزانا نافاجاس ،
  • إميليو سالازار - تبرع ،
  • كارولينا فرنانديز كوستا ،
  • جون ر.ييتس الثالث* ، و
  • خوان بابلو البر

تطورت البروتينات القائمة على قياس الطيف الكتلي إلى تقنية عالية الإنتاجية يتم فيها إنشاء العديد من مجموعات البيانات واسعة النطاق من منصات تحليلية متنوعة. علاوة على ذلك ، أكدت العديد من المجلات العلمية ووكالات التمويل على تخزين بيانات البروتينات في المستودعات العامة لتسهيل تقييمها وفحصها وإعادة تحليلها. (1) نتيجة لذلك ، تنمو مستودعات بيانات البروتينات العامة بسرعة. ومع ذلك ، هناك حاجة إلى أدوات لدمج مجموعات بيانات البروتينات المتعددة لمقارنة الميزات التجريبية المختلفة أو لإجراء تحليل مراقبة الجودة. هنا ، نقدم أداة Java جديدة قائمة بذاتها ، Proteomics Assay COMparator (PACOM) ، قادرة على استيراد العديد من تجارب البروتينات ودمجها ومقارنتها في وقت واحد للتحقق من سلامة البيانات البروتينية وكذلك التحقق من جودة البيانات. باستخدام PACOM ، يمكن للمستخدم اكتشاف مصدر الأخطاء التي ربما تم تقديمها في أي خطوة من خطوات سير عمل البروتينات والتي تؤثر على النتائج النهائية. يمكن مقارنة مجموعات البيانات ودمجها بسهولة ، ويمكن تقييم جودة البيانات وإمكانية التكاثر بصريًا من خلال مجموعة غنية من التمثيلات الرسومية لميزات بيانات البروتينات بالإضافة إلى مجموعة متنوعة من مرشحات البيانات. تجعل مرونته وواجهته سهلة الاستخدام PACOM أداة فريدة للاستخدام اليومي في مختبر البروتينات. يتوفر PACOM على https://github.com/smdb21/pacom.

مقاربات كروماتوغرافيا سائلة عالية الأداء ومتبادلة محبة للماء للتوصيف الشامل القائم على قياس الطيف الكتلي لـ N-Glycome لإريثروبويتين بشري مؤتلف
  • زولتان زابو* ,
  • جيمس آر ثاير ،
  • ديتمار ريوش ،
  • يوري أجروسكين ،
  • روزا فينر ،
  • جيف روهرر ،
  • ساشين ب. باتيل ،
  • مايكل كراويتسكي ،
  • أندرياس هوهمر ،
  • نيبويسا أفدالوفيتش ،
  • شاهر حسن خان ،
  • يان ليو و
  • كريستوفر بول

يعد التوصيف الشامل لـ N-glycome للعلاج أمرًا صعبًا لأن الجليكانات قد تحتوي على العديد من التعديلات (على سبيل المثال ، الفسفرة ، الكبريت ، أحماض السياليك مع أسيتيل O-acetylation). يقدم التقرير الحالي مقارنة بين منصتين كروماتوجرافيين للتوصيف الشامل لإريثروبويتين الإنسان المؤتلف (rhEPO) N-glycome. يشتمل النظامان الأساسيان على سير عمل مشترك يعتمد على اشتقاق 2-AB وكروماتوجرافيا التفاعل المحبة للماء (HILIC) وسير عمل جليكان أصلي مرتبط بـ N يستخدم كروماتوغرافيا تبادل الأنيون عالي الأداء (HPAE). تم ربط كلتا المنصتين بمطياف الكتلة Orbitrap ، وسمح تجزئة HCD المعتمد على البيانات بتوضيح هيكلي واثق للجليكانات. حددت كل منصة جليكانات لم يكشف عنها الآخر ، وأظهر كلاهما نقاط القوة والضعف. قدم سير عمل HILIC المعتمد على الأمينية إنتاجية وحساسية أفضل ، وكان له دقة أيزومر جيدة ، وكشف عن وجود أحماض السياليك O- أسيتيل. ومع ذلك ، فقد أظهرت أداءً ضعيفًا تجاه الجليكانات المُفسفرة ولم تكشف عن وجود الجليكانات الكبريتية. علاوة على ذلك ، قدم التصفية المختزلة مصنوعات الجفاف وتعديل ملف تعريف الارتباط بالجليكوزيل في rhEPO glycome. على العكس من ذلك ، قدمت HPAE تصنيفًا غير متحيز للشحنة (مستويات سياليل) ، وتحسن دقة الأيزومر ، وكشفت عن العديد من الهياكل الفسفورية والكبريتية ، ولكنها قدمت إنتاجية أقل ، ولها قمم أثرية بسبب تكوين epimer ، وفقدان حمض السياليك O-acetylation. لم يكن التحديد المستند إلى MS2 للجليكانات المفسفرة والمكبريتية ممكنًا في وضع HILIC بسبب ضعف قابليتها للذوبان الناجم عن تركيزات الأسيتونيتريل العالية المستخدمة في بداية التدرج. بعد تحليل glycome من خلال كلا النهجين وتحديد وجود glycans ، تم إنشاء مكتبة glycan لتحليلات glycopeptide الخاصة بالموقع. أكدت تحليلات Glycopeptide جميع التركيبات المشروحة من خلال الاستخدام المشترك لتدفقات عمل 2-AB- وسير عمل الجليكان الأصلي وقدمت موقعًا محددًا لموقع glycans. كانت هاتان المنصتان مكملتان وقدمت معًا توصيفًا أكثر شمولاً وشمولية لـ rhEPO N-glycome ، مما يدعم المطابقة التنظيمية لصناعة الأدوية.

دراسة التمثيل الغذائي في المصل لمرضى السكري من النوع 2 المعدل بالجليكلازيد والمعالجة بالإفراز باستخدام التحليل الكروماتوجرافي الغازي - طريقة قياس الطيف الكتلي
  • يانغ زو ،
  • تشينغ هو ،
  • شينجي تشاو
  • بينغ لوه ،
  • جينجيي لو ،
  • تشينغ لي ،
  • مياو تشين
  • دندن يان
  • شين لو* ,
  • هونغوي كونغ ،
  • Weiping جيا* ، و
  • Guowang Xu*

السلفونيل يوريا هو أحد الأدوية الشائعة الاستخدام في داء السكري من النوع 2 (T2DM) ولكن مع حدوث فشل أحادي بشكل كبير. ومع ذلك ، فإن آلية استجابة المرضى للأدوية غير واضحة ، والعلامات الحيوية لتقييم الملاءمة في حاجة ماسة إلى الطب الدقيق. في هذه الدراسة ، تم استخدام طريقة كروماتوغرافيا الغاز الموجهة الكاذبة - طريقة قياس الطيف الكتلي لفحص التنميط الأيضي في المصل لـ 66 من المستجيبين المهمين و 24 مستجيب غير مهم عند خط الأساس و 16 أسبوعًا بعد العلاج الأحادي بتحرير الغليكلازيد (MR). ارتبطت التحسينات السريرية في مستوى الجلوكوز في الدم وحساسية الأنسولين ارتباطًا وثيقًا بالتغيرات في دورة TCA ، واستقلاب الجسم الكيتون ، وأكسدة الدهون ، وتقويض الأحماض الأمينية المتفرعة السلسلة ، واستقلاب النباتات المعوية. يشير التنميط الأيضي الأساسي المختلف الذي لوحظ في المجموعتين إلى أن المرضى الذين يعانون من انخفاض مستوى شحميات الدم قد يكونون أكثر ملاءمة لعلاج السلفونيل يوريا. تُظهر لوحة العلامات الحيوية المكونة من HbA1c و 5،8،11،14،17-eicosapentaenoic acid و methyl 8،11،14-eicosatrienoate و methyl hexadecanoate قدرة تنبؤ جيدة جدًا لمدى ملاءمة معالجة الغليكلازيد ، وقد تكون ذات مغزى في الطب الشخصي لمرضى T2DM عن طريق علاج السلفونيل يوريا.

اكتشاف العلامات الحيوية المظهرية المُحسَّنة والقضاء غير المتضارب عن طريق الإسقاط المعدل المتغير إلى الهياكل الكامنة من بيانات التحليل الطيفي الاستقلابي
  • جورام م* ,
  • إيزابيل جارسيا بيريز ،
  • تيموثي إم دي إيبلز ،
  • جون سي ليندون ،
  • إرميا ستاملر
  • بول إليوت ،
  • إيلين هولمز ، و
  • جيريمي ك.نيكلسون*

يتم تغيير التمثيل الغذائي عن طريق الوراثة والنظام الغذائي وحالة المرض والبيئة والعديد من العوامل الأخرى. غالبًا ما يتم نمذجة أي من هذين الأمرين دون مراعاة تأثيرات المتغيرات المشتركة الأخرى. يجب أن يتم عزو الاختلافات في ملف التمثيل الغذائي إلى أحد هذه العوامل أثناء التحكم في التأثير الأيضي للباقي. نصف هنا إطار عمل لتحليل البيانات وخوارزمية تعديل مؤكد جديدة لتحليل متعدد المتغيرات لبيانات التنميط الأيضي. باستخدام البيانات المحاكاة ، نظهر أنه تم العثور على أعداد مماثلة من الارتباطات الحقيقية وإيجابيات خاطئة أقل بشكل ملحوظ مقارنة بالطرق الأخرى الشائعة الاستخدام. يتم هنا توضيح الإسقاطات المعدلة ذات المتغير المشترك للهياكل الكامنة (CA-PLS) باستخدام دراسة النمط الظاهري الأيضي على نطاق واسع لاثنين من السكان الصينيين في مخاطر مختلفة للإصابة بأمراض القلب والأوعية الدموية. باستخدام CA-PLS ، وجدنا أن بعض الاختلافات التي تم الإبلاغ عنها سابقًا مرتبطة فعليًا بالعوامل الخارجية واكتشاف عدد من المؤشرات الحيوية التي لم يتم الإبلاغ عنها سابقًا والمرتبطة بمسارات التمثيل الغذائي المختلفة. يمكن تطبيق CA-PLS على أي بيانات متعددة المتغيرات حيث قد يكون الخلط مشكلة ويكون إجراء الضبط المربك قابلًا للترجمة إلى تقنيات الانحدار متعدد المتغيرات الأخرى.

استراتيجية البحث في قواعد البيانات الموجهة للتصنيف الميتاجينومي لتحسين التحليل الميتابروتيوم
  • جينكيو شياو ،
  • أليساندرو تانكا ،
  • بن جيا ،
  • رونكينغ يانغ ،
  • بو وانغ ،
  • يو زانغ و
  • جينغ لي*

توفر الميتابروتيوميات مقياسًا مباشرًا للمعلومات الوظيفية من خلال فحص جميع البروتينات التي تعبر عنها الكائنات الحية الدقيقة. ومع ذلك ، نظرًا لتعقيد وعدم تجانس المجتمعات الميكروبية ، من الصعب جدًا إنشاء قاعدة بيانات تسلسلية مناسبة لدراسة الميتابروتيوم. باستخدام قاعدة بيانات عامة ، قد لا يتمكن الباحثون من تحديد البروتينات من الأنواع الميكروبية سيئة التوصيف ، في حين أن قاعدة البيانات الميتاجينومية القائمة على التسلسل قد لا توفر تغطية كافية لجميع تسلسلات البروتين التي يُحتمل التعبير عنها. لمواجهة هذا التحدي ، نقترح إستراتيجية البحث في قاعدة البيانات الموجهة بالتصنيف الميتاجينومي (MT) ، والتي يتم فيها استخدام قاعدة بيانات مدمجة ، تتكون من تسلسلات البروتين المرجعي الموجهة بالتصنيف من قواعد البيانات العامة والبروتينات من تجميع الميتاجينوم. من خلال تطبيق إستراتيجية MT الخاصة بنا على خليط ميكروبي وهمي ، تم اكتشاف حوالي ضعف عدد الببتيدات كما هو الحال في قاعدة البيانات metagenomic فقط. وفقًا لتقييم موثوقية الإسناد التصنيفي ، كان معدل التخصيصات الخاطئة مماثلاً لتلك التي تم الحصول عليها باستخدام قاعدة بيانات مطابقة مسبقًا. قمنا أيضًا بتقييم استراتيجية الترجمة الآلية باستخدام عينة جرثومية من الأمعاء البشرية ، ووجدنا 1.7 ضعف عدد الببتيدات باستخدام قاعدة بيانات ميتاجينومية قياسية. في الختام ، تسمح إستراتيجية الترجمة الآلية لدينا ببناء قواعد بيانات قادرة على توفير حساسية عالية ودقة في تحديد الببتيد في دراسات الميتابروتيوم ، مما يسمح باكتشاف البروتينات من الأنواع سيئة التوصيف داخل الكائنات الحية الدقيقة.

التحليل المنهجي للأحماض الدهنية في الخلايا البشرية باستخدام علامة متساوية الضغط (TMT) - طريقة قائمة

الأحماض الدهنية (FAs) هي مكونات أساسية في الخلايا وتشارك في العديد من الأنشطة الخلوية. تم الإبلاغ عن أن التمثيل الغذائي غير الطبيعي للكرة الأرضية يرتبط بأمراض بشرية مثل السرطان وأمراض القلب والأوعية الدموية. يوفر تحديد وتقدير FAs نظرة ثاقبة لوظائفها في الأنظمة البيولوجية ، ولكن من الصعب للغاية تحليلها بسبب هياكلها وخصائصها. في هذا العمل ، قمنا بتطوير طريقة جديدة من خلال دمج FAs الموسومة بالنظائر المستقرة المسمى aminoxy tandem mass tags (aminoxyTMTs) والتحليل الطيفي الكتلي في الوضع الإيجابي. على أساس هياكلها ، تفاعلت كواشف aminoxyTMT مع مجموعة حمض الكربوكسيل في FAs ، مما أدى إلى ظهور مجموعة أمين ذات تقارب بروتون عالٍ مرتبطة تساهميًا بالمواد التحليلية. مكن هذا من تحليل FAs تحت تأثير التأين بالرش الكهربائي الإيجابي - قياس الطيف الكتلي (ESI-MS) ، والذي عادة ما يكون أكثر شيوعًا وحساسية مقارنة بالوضع السلبي. الأهم من ذلك ، أن علامات TMT متعددة الإرسال سمحت لنا بتحديد FAs من عدة عينات في وقت واحد ، مما أدى إلى زيادة الإنتاجية التجريبية ودقة القياس الكمي. تم تصنيف FAs المستخرجة من ثلاثة أنواع من خلايا الثدي ، مثل MCF 10A (طبيعي) ، و MCF7 (طفيف التوغل) وخلايا MDA-MB-231 (شديدة التوغل) ، بخلايا aminoxyTMTs المكونة من ستة صفحات ومحددة كميًا بواسطة LC-MS / MS . أظهرت النتائج أن وفرة بعض FAs ، مثل C22: 5 و C20: 3 ، زادت بشكل ملحوظ في الخلايا السرطانية MCF7 و MDA-MB-231 مقارنة بخلايا MCF 10A الطبيعية. لأول مرة ، تم استغلال كواشف aminoxyTMT لتسمية FAs لتحديدها وتقديرها في العينات البيولوجية المعقدة في وضع MS الإيجابي. مكنتنا الطريقة الحالية من تحديد FAs بثقة وتحديدها بدقة من عدة عينات في وقت واحد. نظرًا لأن هذه الطريقة لا تحتوي على قيود على العينات ، فيمكن تطبيقها على نطاق واسع في الأبحاث البيولوجية والطبية الحيوية.

الهيكل الأساسي والعالي لمركز التفاعل من البكتيريا الضوئية الأرجواني Blastochloris viridis: اختبار مطياف الكتلة الأصلية
  • يو لو ،
  • كاري جودسون ،
  • روبرت إي بلانكينشيب* ، و
  • مايكل ل*

كان مركز التفاعل (RC) من بكتيريا Blastochloris viridis الضوئية هو أول مركب بروتين غشائي متكامل تم تحديد هيكله بواسطة علم البلورات بالأشعة السينية وقد تمت دراسته على نطاق واسع منذ ذلك الحين. وهو يتألف من أربع وحدات بروتينية فرعية ، H ، M ، L ، و C ، بالإضافة إلى العوامل المساعدة ، بما في ذلك البكتيريا الجرثومية (BPh) ، والكلوروفيل البكتيري (BCh) ، والميناكينون ، والأوبيكوينون ، والهيم ، والكاروتينويد ، والحديد. في هذه الدراسة ، استخدمنا البروتينات القائمة على قياس الطيف الكتلي لدراسة هذا المركب البروتيني عبر التسلسل من أسفل إلى أعلى ، وتحليل كتلة البروتين السليم ، وتحليل ربط ربط MS الأصلي. يُظهر هيكلها الأساسي سلسلة من الطفرات ، بما في ذلك تغيير غير عادي وتمديد على الطرف C للوحدة الفرعية M. فيما يتعلق بالبنية الرباعية ، فإن البروتينات مثل هذه التي تحتوي على العديد من العوامل المساعدة تعمل على اختبار القدرة على إدخال مجموعات بروتين الحالة الأصلية في الطور الغازي لأن العوامل المساعدة لن يتم الاحتفاظ بها إذا كان الهيكل الرباعي مضطربًا بشكل خطير. علاوة على ذلك ، يُظهر هذا RC المحدد ، تحت MS الأصلي ، قدرة قوية ليس فقط على ربط الزوج الخاص ولكن أيضًا للحفاظ على جهازي BCh المحيطيين.

تحليل كروماتوجرافي سائل فائق الأداء - طريقة استقلابية لقياس الطيف الكتلي لوقت الرحلة لدراسة تأثير استهلاك النبيذ الأحمر المعتدل على التمثيل الغذائي في البول
  • أديليدا إستيبان - فرنانديز ،
  • كلارا إيبانيز
  • كارولينا سيمو ،
  • Begoña Bartolomé* ، و
  • م. فيكتوريا مورينو أريباس*

تم وصف الاستهلاك المعتدل للنبيذ الأحمر على نطاق واسع لممارسة العديد من الفوائد في صحة الإنسان. ويرجع ذلك أساسًا إلى محتواه الفريد من مادة البوليفينول النشطة بيولوجيًا ، والتي تعاني من العديد من التعديلات على طول مرورها عبر الجهاز الهضمي ، بما في ذلك التحول الميكروبي في القولون والتمثيل الغذائي في المرحلة الثانية ، حتى يتم إفرازها أخيرًا في البول والبراز. لتحديد تأثير استهلاك النبيذ المعتدل في التمثيل الغذائي العام للمتطوعين الأصحاء (ن = 41) ، تم فحص عينات من دراسة تداخلية للنبيذ الأحمر (250 مل / يوم ، 28 يومًا). تم جمع البول (24 ساعة) قبل وبعد التدخل وتحليله من خلال طريقة كروماتوجرافيا سائلة غير مستهدفة عالية الأداء - طريقة التمثيل الغذائي لقياس الطيف الكتلي لوقت الرحلة. 94 مركبًا مرتبطًا باستهلاك النبيذ ، بما في ذلك مكونات النبيذ المحددة (حمض الطرطريك) ، والمستقلبات الفينولية المشتقة من الميكروبات (5- (ثنائي هيدروكسي فينيل) -γ-valerolactones و 4-هيدروكسيل -5 (فينيل) -أحماض الفاليريك) ، والمركبات الذاتية كانت المحددة. كما تمت مناقشة بعض العلاقات بين المستقلبات البولية والبرازية المتوازية.

يكشف الأيض بالرنين المغناطيسي النووي عن آثار وقائية بوساطة الأيض في خلايا الكبد (HepG2) المعرضة لمستويات شبه سامة من جزيئات الفضة النانوية
  • جوانا كارولا ،
  • ريكاردو جي بي بينتو ،
  • مريم نصيربور
  • كارمن إس آر فريري ،
  • آنا م. جيل ،
  • كونسيساو سانتوس ،
  • هيلينا أوليفيرا و
  • إيولا ف. دوارتي*

يزيد التوسع في التطبيقات الطبية الحيوية والعلاجية لجسيمات الفضة النانوية (AgNPs) من الحاجة إلى زيادة فهم آثارها البيولوجية على الخلايا البشرية. في هذا العمل ، تم تطبيق مستقلبات الرنين المغناطيسي النووي للكشف عن التأثيرات الأيضية لـ AgNPs تجاه خلايا الورم الكبدي البشري (HepG2) ، والتي تتعلق بتراكم الجسيمات النانوية وإزالة السموم. تمت مقارنة الاستجابات الخلوية لـ AgNPs المغلفة بالسترات (Cit30) المنتشرة على نطاق واسع و AgNPs الناشئة عن طريق استخدام مستخلص نبات مائي كعامل مخفض ومثبت (GS30) بهدف تقييم تأثير طلاء الجسيمات النانوية على التأثيرات الأيضية المنتجة. تسببت التركيزات شبه السامة (IC5 و IC20) لكلا النوعين من الجسيمات النانوية في حدوث تغييرات عميقة في الأيض الخلوي ، مما يشير إلى تكيفات في عمليات إنتاج الطاقة (استقلاب الجلوكوز ونظام الفوسفوكرياتين) ، والدفاعات المضادة للأكسدة ، وتدهور البروتين واستقلاب الدهون. تم اقتراح هذه التواقيع لتعكس بشكل أساسي آليات الحماية التي تتم بوساطة التمثيل الغذائي ووجد أنها شائعة إلى حد كبير مع Cit30 و GS30 AgNPs ، على الرغم من اكتشاف الاختلافات في حجم الاستجابة ، التي لم يتم التقاطها من خلال تقييم السمية الخلوية التقليدي. بشكل عام ، تسلط هذه الدراسة الضوء على قيمة استقلاب الرنين المغناطيسي النووي في الكشف عن التأثيرات البيولوجية شبه السامة والمساعدة في فهم التفاعلات بين الخلايا والمواد النانوية.

تكشف بروتيوميات البيرة عن بروتين ديناميكي مع تعديلات واسعة النطاق
  • بنجامين إل شولز* ,
  • Toan K. Phung ،
  • ميشيل بروشي ،
  • Agnieszka Janusz ،
  • جيف ستيوارت
  • جون ميهان
  • بيتر هيلي ،
  • أماندا س. نوينز ،
  • جلين ب. فوكس* ، و
  • كلوديا إي فيكرز*

إنتاج البيرة الحديث عملية صناعية معقدة. ومع ذلك ، لا تزال بعض تفاصيله البيوكيميائية غير واضحة. باستخدام بروتيوميات قياس الطيف الكتلي ، أجرينا تحليلًا عالميًا غير مستهدف للبروتينات الموجودة عبر الوقت أثناء إنتاج البيرة على نطاق نانوي. تضمنت العينات نبتة حلوة يتم إنتاجها عن طريق هريس منقوع بدرجة حرارة عالية ونبتة قافزة وبيرة مشرقة. حدد هذا التحليل أكثر من 200 بروتين فريد من الشعير والخميرة ، مما يؤكد على تعقيد العملية والمنتج. ثم استخدمنا البيانات المستقلة SWATH-MS للمقارنة الكمية الوفرة النسبية لهذه البروتينات طوال العملية. حدد هذا تغييرات كبيرة وهامة في البروتين في كل خطوة من خطوات العملية. وصفت هذه التغييرات إثراء البروتينات بخصائصها الفيزيائية الحيوية ، وحددت ظهور بروتينات الخميرة السائدة أثناء التخمير. كما أدت المستويات المتغيرة من تعديل الشعير إلى تغيير البروتينات كميًا خلال العملية. كشف الفحص التفصيلي للبيانات البروتينية أن العديد من البروتينات تم تعديلها عن طريق هضم البروتياز أو الجلوكوز أو الأكسدة أثناء خطوات المعالجة. يوضح هذا العمل الفرص التي توفرها بروتيوميات قياس الطيف الكتلي الحديثة في فهم العملية القديمة لإنتاج البيرة.

تحديد نسب الفسفرة الخاصة بالموقع في البروتينات باستخدام مطياف الكتلة المستهدفة
  • لينارد جي إم ديكر ،
  • لونا زينيدبور ،
  • ساندور سنويرز
  • جوس جور ،
  • سيجر لينسترا و
  • ثيو إم لويدر*

نوضح أنه يمكن استخدام مراقبة التفاعل الموازي (PRM) للتقدير الدقيق لنسب الفسفرة للبروتينات باستخدام الببتيدات المستقرة المسمى بالنظائر. لقد قارنا طريقتين مختلفتين PRM على خلاصة ثقافة خلية U87 ، وهما Direct-PRM (هضم تجريبي يقاس بواسطة PRM دون أي تحضير إضافي للعينة) و TiO2-PRM (هضم تجريبي غني بخراطيش TiO2 ، متبوعًا بقياس PRM) تتم مقارنة هذه الأساليب بمواقع الفسفرة التالية: البروتين المرتبط بتمايز الخلايا العصبية (AHNAK S5480-p) ، والكالسيوم / بروتين كيناز النوع الثاني المعتمد على الكالسيوم / كالودولين (CAMK2D T337-p) ، ومستقبل عامل نمو البشرة (EGFR S1166-p). ). يمكن تحديد نسبة قابلة للتكرار من الفسفرة (CV 6-13٪) باستخدام PRM المباشر أو TiO2-PRM. بالإضافة إلى ذلك ، اختبرنا الأساليب في تجربة زراعة الخلايا التي حُرمت فيها خلايا U87 من مصل الدم. كمعيار ذهبي ، قمنا بتضمين الترسيب المناعي لـ EGFR متبوعًا بـ PRM (IP-PRM). بالنسبة إلى EGFR (S1166) و AHNAK (S5480) ، يمكن ملاحظة تغيير إحصائي مهم في النسبة المئوية للفسفرة نتيجة الحرمان من المصل لـ EGFR (S1166) لوحظ هذا التغيير لكل من TiO2-PRM و IP-PRM. النهج المقدم لديه القدرة على تعدد الإرسال وتحديد نسبة الفسفرة في تحليل واحد.

التغييرات الديناميكية في توطين البروتين في البيئة النووية في خلية البنكرياس بعد تحفيز قصير للجلوكوز
  • تايووك كانغ ،
  • بيا جنسن ،
  • فيتا سولوفيفا ،
  • جوناثان ر. بروير ، و
  • مارتن ر لارسن*

توصيف الآليات الجزيئية الكامنة وراء وظيفة خلايا البنكرياس فيما يتعلق بإفراز الأنسولين المحفز بالجلوكوز غير مكتمل ، خاصة فيما يتعلق بالاستجابة العالمية في البيئة النووية. نحن نركز على توصيف البروتينات في البيئة النووية للخلايا بعد تحفيز قصير وعالي للجلوكوز. قارنا النوى المنقاة المشتقة من خلايا بيتا المحفزة بجلوكوز 17 ملي مولار لمدة 0 و 2 و 5 دقائق باستخدام البروتينات الكمية ، وهو إطار زمني على الأرجح لا يؤدي إلى ترجمة بروتين جديد في الخلية. من بين البروتينات المنظمة تفاضليًا ، حددنا 20 مكونًا لعمليات التنظيم النووي ، بما في ذلك تنظيم المسام النووي ، ومركب البروتين النووي ، ونسخ ما قبل الرنا المرسال. لقد وجدنا تغييرًا في مجمع المسام النووي ، جنبًا إلى جنب مع مرافقات مرتبطة بالكالسيوم / كالودولين والتي تسهل استيراد البروتين والحمض النووي الريبي أو تصديره إلى / من النواة إلى السيتوبلازم. تم تحديد العوامل المرتبطة بنسخ الأنسولين mRNA المفترض بين البروتينات المنظمة ، وتم التحقق من صحتها من خلال التصوير الغربي والتصوير المناعي متحد البؤر. بشكل جماعي ، تشير بياناتنا إلى أن انتقال البروتين بين النواة والسيتوبلازم هو عملية مهمة ، تشارك بشكل كبير في الآلية الجزيئية الأولية الكامنة وراء إفراز الأنسولين المحفز بالجلوكوز في خلايا البنكرياس.

يعد PPARα ضروريًا للتنشيط الناجم عن الإشعاع لإشارات TGFβ غير الكنسية في القلب
  • فيكرام سوبرامانيان ،
  • سابين بورشارد ،
  • أوميد عظيم زاده
  • وولفجانج سيفرت ،
  • جوليان ميرل فام ،
  • مارياتريسا مانكوسو ،
  • إيمانويلا باسكوالي ،
  • غابرييل مولثوف ،
  • باستيان بوبر
  • هانز زيشكا ،
  • مايكل جيه أتكينسون ، و
  • Soile Tapio*

من المعروف أن الجرعات العالية من الإشعاع المؤين تسبب آثارًا ضائرة مثل الالتهاب والتليف في القلب. من المعروف أن منظمات النسخ PPARα و TGFβ متورطة في هذه الاستجابة الإشعاعية. يتم تعطيل PPARα ، وهو عامل نسخ مضاد للالتهابات يتحكم في استقلاب طاقة القلب ، عن طريق التشعيع. يتم تنشيط TGFβ المؤيد للالتهابات والمؤيد للليف عن طريق التشعيع عبر المسارات المعتمدة على SMAD والمستقلة عن SMAD. كان الهدف من هذه الدراسة هو استكشاف كيفية تأثير تغيير مستوى PPARα على الاستجابة الإشعاعية لمسارات الإشارات هذه. لهذا الغرض ، استخدمنا الفئران C57Bl / 6 المعدلة وراثيًا من النوع البري (+ / +) ، متغاير الزيجوت (+/−) أو النمط الجيني المتماثل (- / -) PPARα. تم تشعيع الفئران محليًا إلى القلب باستخدام جرعات من 8 أو 16 غراي ، وتم تعريض الفئران للإشعاع الوهمي. تم فحص أنسجة القلب باستخدام البروتينات الخالية من الملصقات بعد 20 أسبوعًا من التعرض للإشعاع وتم التحقق من صحة المسارات المتوقعة باستخدام التخثر المناعي وإليزا والكيمياء الهيستولوجية المناعية. أظهرت الفئران المتغايرة الزيجوت PPARα معظم التغيرات التي يسببها الإشعاع في بروتين القلب ، بينما أظهرت الفئران المتماثلة الزيجوت PPARα أقل التغييرات. تسبب التشعيع في إشارة TGFβ المعتمدة على SMAD بشكل مستقل عن حالة PPARα ، لكن وجود PPARα كان ضروريًا لتنشيط المسار المستقل عن SMAD. تشير هذه البيانات إلى الدور المركزي لـ PPARα في استجابة القلب للإشعاع المؤين.

الجسيمات الدقيقة المنتشرة من سرطان البنكرياس تسرع الهجرة وانتشار خلايا PANC-1
  • مينغروي آن ،
  • جيانهوي تشو ،
  • جينغ وو ،
  • كايل سي كونيو* ، و
  • ديفيد م. لوبمان*

الحويصلات الدقيقة المتداولة قادرة على التوسط في الاتصالات الخلوية بين الخلايا بعيدة المدى. من الضروري فهم كيفية تأثير الحويصلات الدقيقة من سرطان البنكرياس على الخلايا الأخرى في الجسم. في هذا العمل ، تم عزل الحويصلات المجهرية المشتقة من المصل من 10 مرضى مصابين بسرطان البنكرياس المتقدم محليًا والضوابط الصحية. باستخدام كواشف Cell Transwell و WST-1 ، وجدنا أن الحويصلات المجهرية من سرطان البنكرياس تسرع الهجرة وانتشار خلايا PANC-1. وفي الوقت نفسه ، تأثر تكاثر هذه الخلايا المعالجة بالسرطان المجهرية (CMTCs) بدرجة أقل بمقدار 10 ميكرومتر من الجيمسيتابين بالنسبة للخلايا السليمة المعالجة بالحويصلات المجهرية (HMTCs). بعد ذلك ، قمنا بتحسين طريقة تحضير العينة بمساعدة المرشح لزيادة استرداد عينات البروتين ثم طبقناها على القياس الكمي لبروتينات CMTCs و HMTCs. تم تصنيف الببتيدات وتحليلها بواسطة كروماتوجرافيا سائلة - قياس طيف الكتلة الترادفية. في المجموع ، تم تحديد 4102 بروتينًا ، حيث تم تنظيم 35 بروتينًا مع 27 خاضعًا للتنظيم في CMTCs. لقد تحققنا من النتائج الكمية لثلاثة بروتينات رئيسية CD44 و PPP2R1A و TP53 بواسطة لطخة ويسترن. كشف تحليل مسار الإبداع عن مسارات قد تشارك فيها الحويصلات الدقيقة السرطانية لتعزيز هجرة الخلايا وتكاثرها. قد توفر هذه النتائج أدلة جديدة لعلاج الأورام ورم خبيث.

يكشف التحليل التفاعلي أن منظم إشارات البروتين G 14 (RGS14) هو عبارة عن شريك ملزم للكالسيوم / Calmodulin (Ca 2+ / CaM) و CaM Kinase II (CaMKII)
  • بول آر إيفانز ،
  • كايل ج.
  • إريك ب. دامر ،
  • دوك إم.
  • Devrishi Goswami ،
  • دانيال جيه.
  • خوان زو ،
  • جيني ج يانغ ،
  • سيرينا دوديك ،
  • باتريك ر. جريفين ،
  • نيكولاس ت. سيفريد ، و
  • جون ر.هيبلر*

المنظم لـ G Protein Signaling 14 (RGS14) هو بروتين سقالة معقد يدمج مسارات إشارات البروتين G و MAPK. في دماغ الفأر البالغ ، يتم التعبير عن RGS14 في الغالب في الخلايا العصبية CA2 في الحصين حيث يثبط بشكل طبيعي اللدونة المتشابكة والتعلم والذاكرة المعتمدين على الحصين. ومع ذلك ، فإن بروتينات الإشارة التي يستخدمها RGS14 محليًا لتنظيم اللدونة غير معروفة. هنا ، نظهر أن RGS14 موجود في مركب بروتين عالي الوزن الجزيئي في الدماغ. لتحديد شركاء تفاعل الخلايا العصبية RGS14 ، تعرض RGS14 المناعي الداخلي من دماغ الفأر إلى قياس الطيف الكتلي والتحليل البروتيني. وجدنا أن RGS14 يتفاعل مع البروتينات الرئيسية بعد المشبكي التي تنظم اللدونة. يكشف تحليل الأنطولوجيا الجينية أن أكثر تفاعلات RGS14 المخصب لها أدوار وظيفية في ارتباط الأكتين ، وربط الكالودولين (CaM) ، ونشاط بروتين كيناز المعتمد على CaM (CaMK). نتحقق من صحة هذه النتائج باستخدام فحوصات كيميائية حيوية تحدد التفاعلات مع شريكين ملزمين غير معروفين سابقًا. أبلغنا أن RGS14 يتفاعل مباشرة مع Ca2 + / CaM ويتم فسفرته بواسطة CaMKII في المختبر. أخيرًا ، اكتشفنا أن RGS14 يرتبط بـ CaMKII و CaM في الخلايا العصبية CA2 الحصينية. مجتمعة ، تُظهر هذه النتائج أن RGS14 هو مؤثر جديد لـ CaM وقاعدة فسفرة CaMKII مما يوفر نظرة ثاقبة جديدة للآليات التي يتحكم بها RGS14 في اللدونة في الخلايا العصبية CA2.

تفاعلات الحمض النووي الريبي والبروتين مع TDP-43 في محللات الحبل الشوكي البشري في التصلب الجانبي الضموري
  • كاثرين فولكينغ ،
  • بريان أ.
  • شيريل ليسترا لانتز و
  • مايكل جيه سترونج*

إن البروتين المرتبط بالحمض النووي TAR البالغ 43 كيلو دالتون (TDP-43) هو بروتين مرتبط بالحمض النووي الريبي والحمض النووي مع وظائف خلوية متنوعة. في الخلايا العصبية الحركية المتدهورة في التصلب الجانبي الضموري (ALS) ، ينتقل TDP-43 من النواة إلى العصارة الخلوية ، حيث يتم عزلها في شوائب. من المحتمل أن الدور الممرض لـ TDP-43 في ALS يمكن أن يتضمن إما اكتسابًا أو فقدانًا للوظيفة ، اعتمادًا على طبيعة RNA أو مفاعل البروتين. ومع ذلك ، في حين تم تحديد شركاء ربط TDP-43 في مجموعة من الأنظمة النموذجية ومن الدماغ البشري ، فإن المتفاعلات من أنسجة الحبل الشوكي البشري لم يتم تحديدها. في هذه الدراسة ، قمنا بتمييز كل من البروتينات ومتفاعلات RNA TDP-43 من الحبل الشوكي القطني البطني المصاب بمرض عصبي طبيعي (تحكم) ، بما في ذلك ALS المتقطع (sALS) والحالات العائلية التي تؤوي إما متحولة A4T SOD1 أو 3 ′ UTR * c.41G & gtA متحولة FUS / TLS أو التعبير عن التكرارات المرضية c9orf72 الموسعة. كانت تفاعلات RNA مع TDP-43 متشابهة بين التحكم والحبال الشوكية ALS التي تم فحصها بغض النظر عن النمط الجيني. في المقابل ، أظهرت تفاعلات البروتين مع TDP-43 اختلافات ، مع حالات إيواء sALS و mtSOD1 التي تم فحصها تختلف عن تفاعلات البروتين المحددة في طفرة FUS 3 US UTR وحالات c9orf72 الإيجابية المتكررة.


التحليل المعدني لبدء الكراك في مشغلات المفتاح الكهربائي المشكّلة بالأسلاك والمصنوعة من الفولاذ المقاوم للصدأ 17-4 PH

تم العثور على مشغلات المفتاح المصنوعة من الفولاذ المقاوم للصدأ 17-4 PH (تصلب الترسيب) لتشققات دقيقة. تم إخضاع المشغلات المتشققة إلى الفحص المجهري الإلكتروني البصري والمسح الضوئي واختبار الصلابة ، والذي أظهر أن العطل حدث بسبب بدء تشققات التعب والنمو بعد معالجة التفريغ الكهربائي (EDM). بقيت الطبقة المعاد صلابتها التي تنتجها EDM بعد المعالجة الآلية ، وقد وفرت الشقوق والمخالفات السطحية المرتبطة بهذه الطبقة مواقع لبدء الشقوق ونموها ، مما أدى في النهاية إلى رفض الأجزاء. تتطلب تفاوتات الأبعاد القريبة على المشغلات معالجة ما بعد المعالجة الحرارية. تم قياس سماكة الطبقة المعاد صياغتها بحوالي 38-55 ميكرومتر ، ويعتبر الترسيب بالقرب من السطح المشكل مصدرًا محتملاً للتآكل. تم استخدام التلميع بعد المعالجة الآلية عن طريق حبيبات الطبقة المميعة لإزالة طبقة إعادة الصياغة والرواسب المرتبطة بها. أثبتت نتائج الاختبار أن إزالة الطبقات السطحية تحسن البنية المجهرية ومقاومة تكون التشققات. أثبت تلميع ما بعد EDM وعمليات التفتيش السنوية اللاحقة أن المشكلة قد تم حلها.

هذه معاينة لمحتوى الاشتراك ، والوصول عبر مؤسستك.


سلوك الشد الميكانيكي والاستجابة الشائكة لليزر الانتقائي المصهور 17-4 الفولاذ المقاوم للصدأ PH

تمت دراسة السلوك الميكانيكي للشد والاستجابة الشظية للفولاذ المقاوم للصدأ المصهور بالليزر الانتقائي (SLM) 17-4 بشكل شامل من خلال اختبار الشد وتجربة تأثير الصفيحة وتوصيف البنية المجهرية في هذه الدراسة. كشفت النتائج عن وجود فولاذ مع اعتماد معدل إجهاد كبير على سلوك الشد الميكانيكي واستجابة الشظية. مع زيادة معدل الإجهاد ، يزداد إجهاد الخضوع للشد ، ولكن لا يوجد اتجاه تباين رتيب لهيكل حبوب الإجهاد الذروة يبقى دون تغيير أولاً ثم تصبح حدود الحبوب عالية الزاوية (HAGBs) تزيد من انخفاض طور مارتينسي في البداية ثم يزداد . هناك ارتباط وثيق بين سرعة التأثير ومعدل الإجهاد وضغط الذروة وحد مرونة Hugoniot (HEL) وقوة الشظية. يزداد معدل الإجهاد ، ذروة الإجهاد و HEL ، بينما تظل قوة الشظية ثابتة تقريبًا مع زيادة سرعة التأثير. مع زيادة سرعة التأثير ، تصبح بنية الحبوب جيدة ، وتزداد HAGBs وتزداد مرحلة مارتينسيت. يعتبر التحول الكبير في الطور مسؤولاً عن السلوك الميكانيكي للشد والاستجابة الشظية ، وقد تم حساب ارتفاع درجة الحرارة لتحليل تأثيره على تحول الطور. سواء كانت الاتجاهات المفضلة على طول اتجاه المبنى أو اتجاه الشد يعتمد على معدل الإجهاد. تظهر عينات الشد والتشظي وضع الكسر المطيل والضرر ينشأ من الفراغات. من المثير للاهتمام أن الفراغات تميل دائمًا إلى الأنوية عند ذوبان حدود البركة. تم توضيح نموذج تطور التلف الشظوي لوصف عملية التلف.

هذه معاينة لمحتوى الاشتراك ، والوصول عبر مؤسستك.


نبذة مختصرة

غالبًا ما تتطلب الجراحة طفيفة التوغل (MIS) والجراحة الأمامية (ALIF) ، أو الانصهار الجانبي القطني (LLIF) تثبيتًا لولبيًا عنقيًا عن طريق الجلد (PSF) لتحقيق الاندماج المحيطي. قد تعمل تقنية التوجيه الروبوتية على زيادة سير العمل لتحسين وضع المسمار وتقليل وقت التشغيل.

للإبلاغ عن الخبرة الجراحية في وضع المسمار عن طريق الجلد بمساعدة الروبوت بعد LLIF.

تمت مراجعة البيانات من عمليات الاندماج مع PSF بمساعدة الروبوت في أوضاع الاستلقاء أو الاستلقاء الجانبي. تم استخدام ذراع توجيه آلي موجه بالتصوير المقطعي المحوسب لوضع اللولب (Excelsius GPS ™ ، Globus Medical Inc ، أودوبون ، بنسلفانيا). سهلت التصوير المقطعي المحوسب بعد الجراحة توطين المسمار. تم حساب الإحداثيات ثلاثية الأبعاد وثنائية الأبعاد لطرف اللولب والذيل ومقارنتها مع المسار المستهدف لحساب أخطاء الاستهداف. تم تعريف الخرق على أنه انتهاك للجدار الجانبي أو الإنسي.

كان وضع اللولب الموجه آليًا ناجحًا في 28/31 مريضًا. في هؤلاء المرضى ، تم زرع 116/116 براغي بنجاح. وبلغ معدل الاختراق 3.4٪ (4/116).عبر 17 مريضًا (70 برغيًا) ، كان متوسط ​​الدقة ثلاثية الأبعاد 5.0 ± 2.4 مم ، وكان متوسط ​​الدقة ثنائية الأبعاد 2.6 ± 1.1 مم ، وكان متوسط ​​الإزاحة الزاوية 5.6 ± 4.3 درجة مع معاملات الارتباط المقابلة داخل الطبقة (ICC) البالغة 0.775 و 0.693. دقة ثلاثية الأبعاد مرتبطة بالعمر (R = 0.306 ، ص = .011) ومؤشر كتلة الجسم (R = 0.252 ، ص = .038). لم تختلف الدقة بشكل كبير بين مستويات الجسم الفقري (ص & GT. 22). كان متوسط ​​الوقت التشغيلي لـ MIS-TLIF والبراغي عن طريق الجلد 277 ± 52 و 183 ± 54 دقيقة ، على التوالي. لم ينخفض ​​وقت العملية بشكل ملحوظ عبر أي من المجموعتين (ص & GT. 187).

يتيح نظام التوجيه الروبوتي Excelsius GPS ™ دقة PSF في معظم الحالات بدقة 2 مم 2-D. هناك حاجة لدراسات مستقبلية لإثبات فائدة نظام التوجيه الجديد هذا وتحسين سير العمل.


نبذة مختصرة

تمت دراسة تأثيرات خصائص المسحوق (شكل المسحوق وحجمه ونوعه) وظروف المعالجة (قوة الليزر وسرعة المسح) على الخواص الميكانيكية والبنى المجهرية لانصهار طبقة المسحوق بالليزر (L-PBF) 17-4 الفولاذ المقاوم للصدأ PH باستخدام أربعة أنواع من المساحيق. تعد الكثافة النظرية المئوية وقوة الشد القصوى وصلابة أجزاء L-PBF حساسة لكثافة الطاقة وشكل مسحوق البداية وحجمه ونوعه. زادت الكثافة والخصائص الميكانيكية لكل من الماء والغاز المساحيق مع زيادة كثافة الطاقة. الغاز المصغر (د50 = 13 ميكرومتر) مساحيق كروية الشكل وذات ذرات مائية (د50 = 17 ميكرومتر) مساحيق ذات كثافة حنفية عالية تنتج مسامية منخفضة وكثافة عالية (

كثافة 97٪) أجزاء L-PBF بكثافة طاقة منخفضة تبلغ 64 و 80 جول / مم 3. أدت الزيادة في كثافة الطاقة إلى 104 J / مم 3 إلى كثافة عالية (97 ± 0.5٪) من الماء والغاز مساحيق جزيئية L-PBF. ومع ذلك ، حتى عند الكثافة النظرية العالية (97 ± 1٪) ، تختلف خصائص أجزاء L-PBF على نطاق واسع نسبيًا (UTS: 500-1100 ميجا باسكال صلابة: 25-39 استطالة HRC: 10-25٪). يمكن أن يعزى هذا الاختلاف الكبير في الخواص الميكانيكية إلى طور المارتينسيت والأوستينيت وكذلك حجم الحبوب في أجزاء L-PBF. علاوة على ذلك ، كان محتوى طور المارتينسيت والأوستينيت وأجزاء L-PBF حساسًا أيضًا لكثافة الطاقة ونوع مسحوق البداية.


البحث العلمي والمنهجية

نظرًا لأن العديد من الإحصائيات لها توزيع طبيعي (في ظل ظروف معينة) ، يمكن استخدام قاعدة 68-95-99.7 لفهم توزيع إحصائيات العينة.

تذكر أن القاعدة 68-95-99.7 تنص على ذلك ، لـ أي التوزيع الطبيعي (الشكل 13.10):

  • 68٪ من القيم تقع ضمن انحراف معياري واحد عن المتوسط
  • 95٪ من القيم تقع ضمن انحرافين معياريين عن المتوسط ​​و
  • 99.7٪ من القيم تقع ضمن 3 انحرافات معيارية عن المتوسط.

تعتمد هذه النسب المئوية فقط على عدد الانحرافات المعيارية ( ( سيجما )) قيمة ( (س )) من الوسط ( ( مو )). يمكن استخدام هذه المعلومات للتعرف على كيفية توزيع القيم.

مثال 17.1 (القاعدة 68-95-99.7) افترض أن ارتفاعات الذكور الأستراليين البالغين لها متوسط ​​ ( mu = 175 ) سم ، وانحراف معياري ( سيجما = 7 ) سم ، و (تقريبًا) تتبع التوزيع الطبيعي. باستخدام هذا النموذج ، ما هي نسبة الرجال الأستراليين البالغين أطول من 182 سم؟

رسم الموقف مفيد (الشكل 17.2). لاحظ أن (175 + 7 = 182 ) سم هو انحراف معياري واحد في الاعلى المعنى. نحن نعلم أن 68٪ من القيم تقع ضمن انحراف معياري واحد عن المتوسط ​​، بحيث تكون 32٪ خارج هذا النطاق (أصغر أو أكبر) (الشكل 17.2). ومن ثم ، فإن 16٪ أطول من انحراف معياري واحد فوق المتوسط ​​، لذا فإن الإجابة تبلغ حوالي 16٪. (16٪ أخرى أقل من انحراف معياري واحد أقل المتوسط ​​، أو أقل من (175-7 = 168 ) سم في الارتفاع.)

مرة أخرى ، تعتمد النسب المئوية فقط على عدد الانحرافات المعيارية ( ( سيجما )) القيمة ( (س )) من الوسط ( ( مو )) ، وليس القيم الفعلية لـ ( مو) و ( سيغما ).

الشكل 17.2: ما هي نسبة الذكور الأستراليين البالغين الذين يزيد طولهم عن 182 سم؟

مثال 17.2 (قاعدة 68-95-99.7) افترض أن ارتفاعات الذكور الأستراليين البالغين لها متوسط ​​ ( mu = 175 ) سم ، وانحراف معياري ( سيجما = 7 ) سم ، و (تقريبًا) تتبع التوزيع الطبيعي. باستخدام هذا النموذج ، ما هي النسبة أقصر من 161 سم؟ مرة أخرى ، رسم الموقف مفيد (الشكل 17.3).

بما أن (175 - (2 مرات 7) = 161 ) ، فإن 161 سم هو انحرافان معياريان أقل المعنى. بما أن 95٪ من القيم تقع ضمن انحرافين معياريين للمتوسط ​​، فإن 5٪ خارج هذا النطاق (نصف أصغر ، ونصف أكبر انظر الشكل 17.3) ، بحيث تكون 2.5٪ أقصر من 161 سم. (2.5٪ أخرى أطول من (175 + 14 = 189 ) سم.)

شكل 17.3: ما هي نسبة الذكور الأستراليين البالغين الذين هم أقصر من 161 سم؟

مرة أخرى ، تعتمد النسب المئوية فقط على عدد الانحرافات المعيارية ( ( سيجما )) القيمة ( (س )) من الوسط ( ( مو )). يسمى عدد الانحرافات المعيارية التي تكون الملاحظة من المتوسط ​​أ (ض ) -درجة. A (z ) -score يتم حسابها باستخدام

[z = frac < sigma>. ] يسمى تحويل القيم إلى (z ) - الدرجات التوحيد.

التعريف 17.1 ( (ض ) -درجة) أ (ض ) -درجة يقيس عدد الانحرافات المعيارية بين القيمة والمتوسط. بالرموز:

[يبدأ ض = فارك< sigma>، tag <17.1> end] حيث (x ) هي القيمة ، ( mu ) هو متوسط ​​التوزيع ، و ( sigma ) هو الانحراف المعياري للتوزيع.

المثال 17.3 ( (z ) -scores) في المثال 17.1 ، النتيجة (z ) لارتفاع 182 سم هي

[z = frac < sigma> = frac <182-175> ​​<7> = 1 ، ] انحراف معياري واحد في الاعلى المعنى.

في المثال 17.2 ، النتيجة (z ) لارتفاع 161 سم هي

[z = frac < sigma> = frac <161-175> ​​<7> = -2 ، ] انحرافان معياريان أقل يعني (أ نفي (z ) -score يعني أن القيمة أقل المعنى).

النتيجة (z ) هي عدد الانحرافات المعيارية الملاحظة بعيدة عن المتوسط. تسمى الدرجة (z ) أيضًا بامتداد قيمة موحدة أو النتيجة القياسية، ويتم حسابها باستخدام المعادلة (17.1). لاحظ أن:

  • (ض ) - الدرجات سلبية للملاحظات أقل يعني ، وإيجابي للملاحظات في الاعلى المعنى.
  • (z ) - الدرجات هي أرقام بدون وحدات (أي أنها ليست بالكيلو جرام أو بالسم أو ما إلى ذلك).

مثال 17.4 (قاعدة 68-95-99.7) ضع في اعتبارك نموذج ارتفاعات الذكور الأستراليين البالغين: التوزيع الطبيعي ، المتوسط ​​ ( mu = 175 ) ، الانحراف المعياري ( سيجما = 7 ) (الشكل 17.1).


17.4: التحليل الكمي

لدراسة كلاسيكية للجنوب الأمريكي (الجنوب العميق، مطبعة جامعة شيكاغو ، 1941) ، جمع ديفيس وزملاؤه بيانات عن 18 امرأة كانت حاضرة في كل من الأحداث الـ 14 للموسم الاجتماعي & quot في المجتمع. من خلال فحص أنماط وجود النساء (أو غيابهن) وفي أي أحداث ، يمكن استنتاج نمط أساسي من الروابط الاجتماعية والفصائل والتجمعات بين النساء. في الوقت نفسه ، من خلال فحص النساء اللواتي حضرن في 14 حدثًا ، يمكن استنتاج الأنماط الكامنة في تشابه الأحداث.

دراسة ديفيس هي مثال على ما أسماه رون برايجر (1974) & quot ازدواجية الأشخاص والجماعات. & quot؛ يلفت بريجر الانتباه إلى التركيز المزدوج لتحليل الشبكة الاجتماعية حول كيفية قيام الأفراد ، من خلال وكالتهم ، بإنشاء هياكل اجتماعية بينما ، الوقت ، تطور الهياكل الاجتماعية واقعًا مؤسسيًا يقيد ويشكل سلوك الأفراد المتضمنين فيها.

البيانات المستخدمة لتحليل الشبكات الاجتماعية ، هي الأكثر شيوعًا ، تقيس العلاقات على المستوى الجزئي ، وتستخدم تقنيات التحليل لاستنتاج وجود البنية الاجتماعية على المستوى الكلي. على سبيل المثال ، ندرس روابط الأفراد (الجزئي) للأنماط التي تسمح لنا باستنتاج البنية الكلية (أي المجموعات).

بيانات ديفيس مختلفة بعض الشيء. يصف الروابط بين مجموعتين من العقد على مستويين مختلفين من التحليل. الروابط التي يحددها ديفيس هي بين الممثلين (النساء) والأحداث (أحزاب الموسم الاجتماعي). تتضمن مثل هذه البيانات مستويين من التحليل (أو مستويين & quotmodes & quot). في كثير من الأحيان ، تسمى هذه البيانات & quot؛ نسب الانتساب & quot؛ البيانات لأنها تصف الجهات الفاعلة المنتسبة (الحالية أو الأعضاء) أي الهياكل الكلية.

توفر البيانات ثنائية الوضع بعض الاحتمالات التحليلية الشيقة للغاية لاكتساب فهم أكبر للعلاقات & quot؛ الماكرو- الجزئي & quot. في بيانات ديفيس ، على سبيل المثال ، يمكننا أن نرى كيف يمكن لخيارات النساء الفردية & quot؛ أن تجعل & quot معنى الأحزاب عن طريق اختيار الحضور أم لا. يمكننا أيضًا أن نرى كيف يمكن للأحزاب ، حيث أن الهياكل الكلية قد تؤثر على اختيارات المرأة الفردية.

بقليل من الإبداع ، يمكنك أن تبدأ في رؤية أمثلة على هذه الأنواع من الهياكل الاجتماعية ذات الوضعين ، أو الهياكل الاجتماعية الكلية والجزئية في كل مكان. العالم الاجتماعي هو أحد & الاقتباسات & quot ؛ حيث يتم دمج الأفراد (والهياكل الأكبر) في هياكل أكبر (والهياكل الأكبر مدمجة في الهياكل الأكبر حجمًا). في الواقع ، يعد تحليل التوتر بين & quotstructure و Agency & quot أو & quotmacro و micro & quot أحد الموضوعات الأساسية في النظرية والتحليل الاجتماعيين.

في هذا الفصل سوف نلقي نظرة على بعض الأدوات التي تم تطبيقها (وفي بعض الحالات ، تم تطويرها) بواسطة محللي الشبكات الاجتماعية لفحص البيانات ثنائية الوضع. نبدأ بمناقشة هياكل البيانات ، ثم ننتقل إلى التصور ، ثم نوجه انتباهنا إلى تقنيات لتحديد الأنماط الكمية والنوعية في البيانات ثنائية الوضع.

بالنسبة لمعظم الأمثلة في هذا الفصل ، سنستخدم مجموعة بيانات جديدة ثنائية الوضع من مشكلة أعمل عليها بالتوازي مع هذا الفصل. تصف البيانات مساهمات عدد صغير من كبار المانحين (أولئك الذين قدموا ما لا يقل عن 1،000،000 دولار أمريكي) لحملات دعم ومعارضة مبادرات الاقتراع في كاليفورنيا خلال الفترة من 2000 إلى 2004. لقد قمنا بتضمين 44 مبادرة. مجموعة البيانات لها وضعان: المانحون والمبادرات.

سنستخدم شكلين مختلفين من البيانات - أحدهما ذو قيمة والآخر ثنائي. تصف البيانات القيمة العلاقات بين المانحين والمبادرات باستخدام مقياس ترتيبي بسيط. يتم ترميز الممثلين كـ -1 إذا قدموا مساهمة معارضة لمبادرة معينة ، و 0 إذا لم يساهموا ، و +1 إذا ساهموا في دعم المبادرة. تصف البيانات الثنائية ما إذا كان المانح قد ساهم (+1) أم لم يساهم (0) في الحملة في كل مبادرة.

جدول المحتويات هياكل البيانات ثنائية الأطراف

الطريقة الأكثر شيوعًا لتخزين البيانات ذات الوضعين هي مصفوفة بيانات مستطيلة من الممثلين (الصفوف) حسب الأحداث (الأعمدة). يوضح الشكل 17.1 جزءًا من مجموعة البيانات القيمة التي سنستخدمها هنا ( عرض البيانات و GT ).

الشكل 17.1. مصفوفة بيانات مستطيلة لبيانات التبرعات السياسية في كاليفورنيا

على سبيل المثال ، قدمت جمعية المعلمين في كاليفورنيا تبرعات معارضة لمبادرة الاقتراع السابع والتاسع والعاشر ، وتبرعًا لدعم الاقتراع الثامن.

من الأساليب الشائعة جدًا والمفيدة جدًا للبيانات ذات الوضعين تحويلها إلى مجموعتين من مجموعات البيانات ذات الوضع الواحد ، ودراسة العلاقات داخل كل وضع على حدة. على سبيل المثال ، يمكننا إنشاء مجموعة بيانات من العلاقات بين الفاعلين والممثلين ، وقياس قوة العلاقة بين كل زوج من الممثلين بعدد المرات التي ساهموا فيها في نفس الجانب من المبادرات ، ملخصة عبر 40 مبادرة . يمكننا أيضًا إنشاء مجموعة بيانات أحادية النمط لروابط مبادرة تلو الأخرى ، مع ترميز قوة العلاقة بعدد المانحين المشتركين بين كل زوج من المبادرات. ال البيانات & gtAffiliations يمكن استخدام الأداة لإنشاء مجموعات بيانات أحادية الوضع من مصفوفة بيانات مستطيلة ذات وضعين. يعرض الشكل 17.2 مربع حوار نموذجي.

الشكل 17.2. حوار البيانات & gtAffiliations لإنشاء علاقات الممثل تلو الفاعل للمانحين في كاليفورنيا

هناك العديد من الخيارات هنا.

لقد اخترنا صف الوضع (الجهات الفاعلة) لهذا المثال. لإنشاء مجموعة بيانات أحادية الوضع بمبادرة من مبادرة ، كنا سنختار عمودي.

هناك طريقتان بديلتان:

ال طريقة المنتجات المتقاطعة يأخذ كل إدخال في الصف للممثل A ، ويضربه في نفس الإدخال للممثل B ، ثم يجمع النتيجة. عادة ، يتم استخدام هذه الطريقة للبيانات الثنائية لأن النتيجة هي عدد التواجد المشترك. باستخدام البيانات الثنائية ، يكون كل منتج واحدًا فقط إذا كان كلا الممثلين & quot؛ حاضرين & quot في الحدث ، ويعطي المجموع عبر الأحداث عدد الأحداث المشتركة - وهو مقياس قيم للقوة.

مثالنا أكثر تعقيدًا بعض الشيء لأننا طبقنا طريقة المنتجات المشتركة على البيانات القيمة. هنا ، إذا لم يتبرع أي من الفاعلين لمبادرة (0 * 0 = 0) ، أو إذا تبرع أحدهما والآخر لم يتبرع (0 * -1 أو 0 * +1 = 0) ، فلا يوجد رابط. إذا تم التبرع بكلاهما في نفس الاتجاه (-1 * -1 = 1 أو +1 * +1 = 1) فهناك رابطة إيجابية. إذا تم التبرع بكلاهما ، ولكن في اتجاهين متعاكسين (+1 * -1 = -1) فهناك ربطة عنق سلبية. مجموع النواتج المتقاطعة هو عدد قيم لغالبية الروابط الإيجابية أو السلبية.

ال طريقة الحد الأدنى يفحص إدخالات الممثلين في كل حدث ، ويختار الحد الأدنى للقيمة. بالنسبة للبيانات الثنائية ، تكون النتيجة مماثلة لطريقة الضرب المتقاطع (إذا كان كلاهما أو أي من الفاعلين صفرًا ، يكون الحد الأدنى صفرًا فقط إذا كان كلاهما واحدًا هو الحد الأدنى). بالنسبة للبيانات القيّمة ، فإن طريقة الحد الأدنى تقول بشكل أساسي: إن العلاقة بين الفاعلين تساوي أضعف روابط الفاعلين بالحدث. يستخدم هذا النهج بشكل شائع عند قياس البيانات الأصلية على أنها قيمة.

يوضح الشكل 17.3 نتيجة تطبيق طريقة المنتجات المتقاطعة على بياناتنا القيمة.

الشكل 17.3. قوة التعادل بين الممثل والممثل (الشكل 17.2)

شاركت نقابة المعلمين في 16 حملة (يحسب الناتج المتقاطع للصف نفسه عدد الأحداث). اتخذت الجمعية نفس الموقف من القضايا مثل الحزب الديمقراطي (الممثل 7) عشر مرات أكثر من اتخاذ الموقف المعاكس (أو لا). اتخذت جمعية المطعم (العقدة 10) موقفًا معاكسًا للسيد بنج (العقدة 9) بشكل متكرر أكثر من دعم الموقف (أو عدمه). باستخدام هذه الخوارزمية ، قمنا بالتقاط الكثير ، ولكن ليس كل المعلومات الموجودة في البيانات الأصلية. يمكن أن تكون النتيجة -1 ، على سبيل المثال ، نتيجة اتخاذ اثنين من الجهات الفاعلة مواقف متناقضة بشأن قضية واحدة ، أو قد يعني أن كلاهما اتخذ مواقف بشأن عدة قضايا - وباختصار ، فقد اختلفا مرة أخرى مما اتفقوا عليه.

أصبحت المصفوفات الناتجة أحادية النمط للممثلين على حدة والأحداث على حدة مصفوفات ذات قيمة تشير إلى قوة الارتباط على أساس التواجد المشترك. يمكن الآن تطبيق أي من طرق التحليل أحادي النمط على هذه المصفوفات لدراسة البنية الدقيقة أو البنية الكلية.

يتم تخزين البيانات ذات الوضعين أحيانًا بطريقة ثانية ، تسمى المصفوفة & quotbipartite & quot. يتم تكوين مصفوفة ثنائية القسم عن طريق إضافة الصفوف كأعمدة إضافية ، والأعمدة كصفوف إضافية. على سبيل المثال ، قد تتكون المصفوفة الثنائية من بيانات الجهات المانحة لدينا من 68 صفًا (23 جهة فاعلة تليها 45 مبادرة) من خلال 68 عمودًا (23 جهة فاعلة تليها 45 مبادرة). تتطابق كتلتي المصفوفة لكل حدث على حدة مع المصفوفة الأصلية ، وعادة ما يتم ترميز الكتلتين الجديدتين (الممثلين حسب الممثلين والأحداث حسب الأحداث) كأصفار. ال تحويل & gt تقوم الأداة بتحويل المصفوفات المستطيلة ذات الوضعين إلى مصفوفات ثنائية الوضع ثنائية الأجزاء. يوضح الشكل 17.4 مربع حوار نموذجي.

الشكل 17.4 حوار Transform & gtBipartite لبيانات التبرعات السياسية في كاليفورنيا

ال القيمة لملء العلاقات داخل الوضع عادةً ما يكون صفرًا ، بحيث يتم ربط الممثلين فقط من خلال التواجد المشترك في الأحداث ، والأحداث مرتبطة فقط من خلال وجود ممثلين مشتركين

بمجرد وضع البيانات في شكل مصفوفة مربعة ثنائية الأجزاء ، يمكن تطبيق العديد من الخوارزميات التي تمت مناقشتها في مكان آخر في هذا النص لبيانات أحادية النمط. هناك حاجة إلى قدر كبير من الحذر في التفسير ، لأن الشبكة التي يتم تحليلها هي شبكة غير عادية للغاية تكون فيها العلاقات عبارة عن روابط بين العقد على مستويات مختلفة من التحليل. بمعنى ما ، يتم التعامل مع الجهات الفاعلة والأحداث كأشياء اجتماعية على مستوى واحد من التحليل ، ويمكن استكشاف خصائص مثل المركزية والاتصال. هذا النوع من التحليل نادر نسبيًا ، لكن لديه بعض الإمكانيات الإبداعية المثيرة للاهتمام.

بشكل أكثر شيوعًا ، نسعى إلى إبقاء الممثلين والأحداث منفصلين & quot لكن & quot؛ متصلين & quot ، والبحث عن أنماط في كيفية ربط الممثلين للأحداث معًا ، وكيف تربط الأحداث الممثلين معًا. سنقوم بفحص بعض التقنيات لهذه المهمة أدناه. على الرغم من ذلك ، فإن الخطوة الأولى الجيدة في أي تحليل للشبكة هي تصور البيانات.

لا توجد مشكلات فنية جديدة في استخدام الرسوم البيانية لتصور بيانات ثنائية الوضع. يتم التعامل مع كل من الممثلين والأحداث كعقد ، ويتم استخدام الخطوط لإظهار روابط الممثلين بالأحداث (لن تكون هناك خطوط من الممثلين إلى الممثلين بشكل مباشر ، أو من الأحداث إلى الأحداث).

في UCINET ، الأداة NetDraw & gtFile & gt مجموعة بيانات مفتوحة و gtUCINET وشبكة وضع gt2 ينتج رسمًا بيانيًا مفيدًا للشبكات الصغيرة. يوضح الشكل 17.5 عرضًا واحدًا لبيانات المتبرعين في كاليفورنيا في شكلها القيم.

الشكل 17.5. شبكة ذات قيمة ثنائية من الجهات المانحة والمبادرات في كاليفورنيا

نظرًا لأن الرسم يحتوي على 68 عقدة (ممثلون بالإضافة إلى مبادرات) ، فهو مشوش بعض الشيء. لقد حذفنا العزلات (المبادرات التي ليس لديها متبرعون مشتركون والمانحون الذين ليس لديهم مبادرات مشتركة) ، وحددنا النقاط في الفضاء باستخدام Gower MDS ، وقمنا بتغيير حجم العقد وتسميات العقد ، وأزلنا رؤوس الأسهم.

يمكننا الحصول على بعض الأفكار من هذا النوع من التصور لشبكة ثنائية الوضع (خاصة عند استخدام نوع من طرق القياس لتحديد النقاط في الفضاء). الممثلون القريبون من بعضهم البعض (مثل Cahualla و Morongo Indians في الزاوية اليسرى السفلية) متصلون لأن لديهم ملفات تعريف متشابهة للأحداث. في هذه الحالة بالذات ، شاركت القبيلتان بشكل مشترك في مبادرات حول المقامرة (ص 70) والبيئة (ص 40). وبالمثل ، فإن بعض مقترحات الاقتراع هي & quot؛ متشابهة & quot؛ من حيث أن لديهم متبرعين مشتركين. ويوجد مانحون معينون في نفس الأجزاء من الفضاء مثل مبادرات معينة - تحديد القضايا (الأحداث) التي تميل إلى التوافق مع الجهات الفاعلة.

هذا هو بالضبط هذا النوع من & quot؛ ness & quot؛ أو & quot؛ المراسلة & quot؛ لمواقع الجهات الفاعلة والأحداث التي تهدف الطرق الرقمية التي تمت مناقشتها أدناه إلى فهرستها. وهذا يعني أن الأساليب الرقمية هي جهود للقبض على مجموعات الممثلين التي تجمعها الأحداث التي تم جمعها معًا من خلال التواجد المشترك للممثلين وما ينتج عنه من & qubundles & quot من الممثلين / الأحداث.

عندما نعمل مع عدد كبير من المتغيرات التي تصف جوانب بعض الظواهر (على سبيل المثال ، العناصر الموجودة في الاختبار كمقاييس متعددة للسمات الأساسية للحكم في الموضوع ومثله) ، فإننا غالبًا ما نركز اهتمامنا على ما تشترك فيه هذه المقاييس المتعددة. & quot باستخدام معلومات حول التباين المشترك بين المقاييس المتعددة ، يمكننا استنتاج البعد أو العامل الأساسي بمجرد قيامنا بذلك ، يمكننا تحديد ملاحظاتنا على طول هذا البعد.نهج تحديد أو تسجيل الحالات الفردية من حيث درجاتها على عوامل التباين المشترك بين المؤشرات المتعددة هو هدف تحليل العوامل والمكونات (وبعض تقنيات القياس الأخرى الأقل شيوعًا).

إذا فكرنا في مشكلتنا ذات الوضعين ، فيمكننا تطبيق هذا & quotscaling & quot المنطق على أي من الممثلين أو على الأحداث. وهذا يعني أنه يمكننا & quotscale & quot أو فهرسة تشابه الممثلين من حيث مشاركتهم في الأحداث - لكن وزن الأحداث وفقًا للاختلاف المشترك بينهم. وبالمثل ، يمكننا تقدير & اقتباس الأحداث من حيث أنماط المشاركة المشتركة للممثلين - لكن وزن الممثلين وفقًا لتكرار حدوثهم المشترك. تقنيات مثل أدوات و gtMDS ويمكن استخدام تحليل العامل أو المكونات الرئيسية في & quotscale & quot أي من الفاعلين أو الأحداث.

من الممكن أيضًا تطبيق هذه الأنواع من منطق القياس على بيانات الفاعل على حدة. تتضمن UCINET طريقتين لتحليل العوامل المرتبطين ارتباطًا وثيقًا ( أدوات & gt2-وضع التحجيم & ​​gtSVD و أدوات & gt2-وضع تحليل عامل التحجيم ) التي تدرس التباين المشترك بين كل من الفاعلين والأحداث في وقت واحد. يشمل UCINET أيضًا أدوات & gt2-وضع التحجيم & ​​gtCorrespondence الذي يطبق نفس المنطق على البيانات الثنائية. بمجرد تحديد الأبعاد الأساسية للتباين المشترك ، يمكننا بعد ذلك & quot ؛ اقتباس & اقتباس كل من الممثلين والأحداث في نفس & quotspace. & quot ؛ يتيح لنا ذلك معرفة الجهات الفاعلة المتشابهة من حيث مشاركتها في الأحداث (التي تم ترجيحها لتعكس المشتركة الأنماط) ، والأحداث المتشابهة من حيث ما يشارك فيه الممثلون (مرجح لتعكس الأنماط الشائعة) ، والممثلين والأحداث التي توجد & quot ؛ تقترب & quot لبعضها البعض.

من الممكن أحيانًا تفسير العوامل أو الأبعاد الأساسية لاكتساب نظرة ثاقبة حول سبب تضافر الفعاليات والأحداث معًا بالطرق التي يفعلونها. بشكل عام ، قد تشكل مجموعات الممثلين والأحداث التي تقع بشكل مشابه & quot؛ & quot؛ & quot؛ & quot؛ & & & quot؛ & & quot؛ & & & quot؛ & & quot؛ & & quot؛ & & quot؛ & quot؛ & quot؛ & quot؛ من العمل الاجتماعي & quot؛

أدناه ، سنطبق هذه الأدوات بإيجاز شديد على البيانات الخاصة بالمانحين الكبار لمبادرات كاليفورنيا في الفترة 2000-2004. هدفنا هو توضيح منطق القياس ثنائي الوضع. المناقشة هنا قصيرة جدًا حول المعالجات التقنية للاختلافات (المهمة) بين التقنيات.

جدول المحتويات تحليل SVD ثنائي الوضع

يعد تحليل القيمة الفردية (SVD) إحدى طرق تحديد العوامل الكامنة وراء البيانات ذات الوضعين (القيمة). تختلف طريقة استخلاص العوامل (القيم المفردة) إلى حد ما عن تحليل العوامل والمكونات التقليدية ، لذلك من المستحسن فحص كل من نتائج تحليل العوامل والمكونات ذات النمط الثنائي SVD.

لتوضيح SVD ، لدينا مدخلات مصفوفة من 23 مانحًا رئيسيًا (أولئك الذين قدموا ما مجموعه أكثر من 1،000،000 دولار أمريكي لخمس حملات أو أكثر) من خلال 44 مبادرة اقتراع في كاليفورنيا. يتم تسجيل كل ممثل على أنه -1 إذا ساهم في معارضة المبادرة ، +1 إذا ساهم لصالح المبادرة ، أو 0 إذا لم يساهم. المصفوفة الناتجة هي بيانات قيّمة يمكن فحصها باستخدام SVD وتحليل العوامل ، ومع ذلك ، فإن العدد المنخفض للمساهمين في العديد من المبادرات ، والتباين المحدود للغاية في المقياس ليس مثاليًا.

يوضح الشكل 17.6 القيم & quotsingular & quot المستخرجة من مصفوفة مستطيلة للمانح على حدة باستخدام أدوات & gt2-وضع التحجيم & ​​gtSVD.

الشكل 17.6. القياس ثنائي الوضع للمانحين والمبادرات في كاليفورنيا من خلال تحليل القيمة الفردية: القيم الفردية

تتشابه القيم & quotsingular & quot مع & quoteigenvalues ​​& quot في تقنيات تحجيم العناصر والمكونات الأكثر شيوعًا. تُظهر النتيجة هنا أن التفاضل & quotspace & quot للتباين بين الجهات المانحة والمبادرات لا يتم التقاطه بشكل جيد من خلال توصيف بسيط. إذا تمكنا بسهولة من فهم الأنماط بأفكار مثل & quotleft / right & quot و & quotfinancial / معنوي & quot كأبعاد أساسية ، فلن يكون هناك سوى عدد قليل من القيم الفردية التي تشرح أجزاء كبيرة من التباين المشترك. تخبرنا هذه النتيجة أن الطرق التي يجتمع بها الممثلون والأحداث معًا & مثل ليست نظيفة وبسيطة وسهلة - في هذه الحالة.

مع وضع هذا التحذير المهم في الاعتبار ، يمكننا فحص كيفية قياس الأحداث والجهات المانحة أو تحديدها أو تحديد موقعها على الأبعاد الأساسية. أولا ، مبادرات الاقتراع. يوضح الشكل 17.7 موقع أو مقياس درجات كل اقتراح من مقترحات الاقتراع على الأبعاد الستة الأساسية الأولى لهذا الفضاء متعدد الأبعاد للغاية.

الشكل 17.7. الجهات المانحة والمبادرات SVD لولاية كاليفورنيا: توسيع نطاق المبادرات

اتضح أن البعد الأول يميل إلى تحديد مكان المبادرات الداعمة للإنفاق العام للتعليم والرفاهية الاجتماعية تجاه قطب واحد ، والمبادرات التي تدعم تقييد السلطة التشريعية تجاه الآخر - على الرغم من أن تفسيرات كهذه ذاتية تمامًا. يبدو أن الأبعاد الثانية والأعلى تشير إلى أنه يمكن أيضًا النظر إلى المبادرات على أنها تختلف عن بعضها البعض بطرق أخرى.

في الوقت نفسه ، تتيح لنا النتائج تحديد الجهات المانحة أو توسيع نطاقها وفقًا للأبعاد الأساسية نفسها. تظهر هذه التحميلات في الشكل 17.8.

الشكل 17.8. الجهات المانحة والمبادرات SVD لولاية كاليفورنيا: توسيع نطاق المانحين

نحو النهاية الإيجابية للبعد الأول (الذي فسرناه سابقًا على أنه لصالح الإنفاق العام) نجد الحزب الديمقراطي ونقابات الموظفين العموميين والمدرسين في القطب المقابل ، نجد الجمهوريين وبعض المجموعات التجارية والمهنية.

غالبًا ما يكون من المفيد تصور مواقع الممثلين والأحداث في مخطط مبعثر محدد بواسطة درجات المقياس على الأبعاد المختلفة. توضح الخريطة في الشكل 17.9 نتائج البعدين الأولين لهذه المساحة.

الشكل 17.9. الجهات المانحة والمبادرات SVD لولاية كاليفورنيا: خريطة ثنائية الأبعاد

نلاحظ أن البعد الأول (من اليسار إلى اليمين في الشكل) يبدو وكأنه يحتوي على أعمدة ومقسمة على أساس الاختلافات بين المبادرات ، يبدو أن البعد الثاني (من الأعلى إلى الأسفل) محدد أكثر بالاختلافات بين المجموعات (باستثناء الاقتراح 56) . لا تحدد النتيجة بشكل واضح وواضح أحداثًا معينة وفاعلين معينين على طول أبعاد خطية قوية. ومع ذلك ، فإنه ينتج بعض المجموعات المثيرة للاهتمام التي تظهر مجموعات من الجهات الفاعلة جنبًا إلى جنب مع القضايا التي تعتبر مركزية لأنماط مشاركتهم. تجمع الديمقراطيين والنقابات (أعلى اليمين) جنبًا إلى جنب مع عدد من المقترحات الخاصة التي كانوا نشطين للغاية فيها (على سبيل المثال 46 ، 63). مجموعة الشركات والبناء والمشاريع الرأسمالية (بشكل أكثر مرونة) في أسفل اليمين ، جنبًا إلى جنب مع القضايا الأساسية التي شكلت جدول أعمالها الأساسي في عملية المبادرة (على سبيل المثال الدعامة 62).

جدول المحتويات تحليل عامل الوضعين

يوفر تحليل العوامل طريقة بديلة لـ SVD للأهداف نفسها: تحديد الأبعاد الأساسية للمساحة المشتركة للتباين بين الفاعلين والحدثين ، وتحديد أو تحديد الجهات الفاعلة والأحداث في تلك المساحة. تختلف الطريقة المستخدمة بواسطة تحليل العوامل لتحديد الأبعاد عن طريقة SVD. يوضح الشكل 17.10 القيم الذاتية (حسب المكونات الأساسية) المحسوبة بواسطة أدوات و gt2-Mode Scaling & gtFactor Analysis.

الشكل 17.10 القيم الذاتية للعوملة ثنائية النمط للمانحين والمبادرات في كاليفورنيا

هذا الحل ، على الرغم من اختلافه عن SVD ، يشير أيضًا إلى تعقيد كبير في الأبعاد في التباين المشترك بين الفاعلين والأحداث. أي أن التوصيفات البسيطة للأبعاد الأساسية (على سبيل المثال & quotleft / right & quot) لا توفر تنبؤات دقيقة للغاية حول مواقع الجهات الفاعلة أو الأحداث الفردية. طريقة تحليل العامل تنتج تعقيدًا أقل إلى حد ما من SVD.

مع وضع التحذير من الملاءمة الضعيفة لحل منخفض الأبعاد في الاعتبار ، دعنا نفحص مقياس الممثلين في العوامل الثلاثة الأولى (الشكل 17.11).

الشكل 17.11. تحميلات المانحين

ينتج العامل الأول ، بهذه الطريقة ، نمطًا مشابهًا لـ SVD. يوجد في أحد القطبين الديمقراطيين والنقابات ، وفي الجانب الآخر توجد العديد من المجموعات الرأسمالية. ومع ذلك ، هناك بعض الاختلافات الملحوظة (مثل AFSCME). يوضح الشكل 17.12 تحميلات الأحداث.

الشكل 17.12. تحميل الأحداث

تتشابه الأنماط هنا أيضًا مع نتائج SVD ، ولكنها تختلف اختلافًا كبيرًا في التفاصيل. لتصور الأنماط ، يمكن استخراج عمليات تحميل الممثلين والأحداث على الأبعاد من ملفات بيانات الإخراج ، ورسمها باستخدام مخطط مبعثر.

جدول المحتويات تحليل المراسلات ثنائية الوضع

بالنسبة للبيانات الثنائية ، لا يوصى باستخدام تحليل العوامل و SVD. تعمل طرق العوملة على مصفوفات التباين / التباين أو الارتباط بين الجهات الفاعلة والأحداث. عندما يتم قياس ارتباطات الجهات الفاعلة بالأحداث على المستوى الثنائي (وهو ما يحدث في كثير من الأحيان في تحليل الشبكة) ، فإن الارتباطات قد تقلل بشكل خطير من التباين المشترك وتجعل من الصعب تمييز الأنماط.

كبديل لتحجيم ثنائي الفاعل حسب الحدث ، فإن طريقة تحليل المراسلات ( أدوات & gt2-وضع التحجيم & ​​gt المراسلات) يمكن استعماله. يعمل تحليل المراسلات (مثل تحليل الصنف الكامن) على جداول ثنائية ثنائية متعددة المتغيرات ، وافتراضات التوزيع الخاصة به مناسبة بشكل أفضل للبيانات الثنائية.

لتوضيح تطبيق تحليل المراسلات ، قمنا بتقسيم بيانات المانح السياسي والمبادرات من خلال تعيين قيمة 1 إذا قدم أحد الفاعلين تبرعًا إما لصالح مبادرة أو ضدها ، وتخصيص صفر إذا لم يشاركوا في الحملة بمبادرة معينة. إذا أردنا أن يركز تحليلنا على الحزبية ، بدلاً من المشاركة البسيطة ، فربما نكون قد أنشأنا مجموعتين من البيانات - واحدة تستند إلى المعارضة أم لا ، والأخرى تستند إلى الدعم أم لا - وإجراء تحليلين منفصلين للمراسلات.

يوضح الشكل 17.13 موقع الأحداث (المبادرات) على طول ثلاثة أبعاد لمساحة الحدث الفاعل المشترك المحددة بواسطة طريقة تحليل المراسلات.

الشكل 17.13. إحداثيات الحدث للمشاركة المشتركة للمانحين في حملات مبادرة كاليفورنيا

نظرًا لأن هذه البيانات لا تعكس الحزبية ، بل المشاركة فقط ، لا نتوقع أن تكون النتائج موازية لتلك التي تمت مناقشتها في الأقسام أعلاه. وهم لا يفعلون ذلك. ومع ذلك ، نرى أنه يمكن أيضًا استخدام هذه الطريقة لتحديد المبادرات على طول أبعاد أساسية متعددة تلتقط التباين في كل من الفاعلين والأحداث. يوضح الشكل 17.14 مقياس الممثلين.

الشكل 17.14. ينسق الممثل للمشاركة المشتركة للمانحين في حملات مبادرة كاليفورنيا

البعد الأول هنا لديه بعض التشابه مع القطب الديموقراطي / النقابي مقابل أقطاب الرأسمالية. ومع ذلك ، يعني هذا الاختلاف هنا أن المجموعتين تميلان إلى المشاركة في مجموعات مختلفة من المبادرات ، بدلاً من مواجهة بعضهما البعض في نفس الحملات.

غالبًا ما يكون التصور هو أفضل نهج لإيجاد أنماط ذات مغزى (في غياب نظرية قوية). يوضح الشكل 17.15 مؤامرة الجهات الفاعلة والأحداث في البعدين الأولين لمساحة تحليل المراسلات المشتركة.

الشكل 17.15. تحليل المراسلات خريطة ثنائية الأبعاد

يحتوي الربع السفلي الأيمن هنا على مجموعة ذات مغزى من الفاعلين والأحداث ، ويوضح كيف يمكن تفسير نتائج تحليل المراسلات. في أسفل اليمين لدينا بعض المقترحات المتعلقة بمقامرة الكازينو الهندية (68 و 70) واثنين من المقترحات المتعلقة بقضايا البيئة / الحفظ (40 و 50). تم تعيين اثنين من الدول الأمريكية الأصلية الرئيسية (مجموعة Cahualla و Morongo من Mission Indians) معًا. والنتيجة هي إظهار أن هناك مجموعة من القضايا التي & quot؛ تحدث & quot مع مجموعة من المانحين - الجهات الفاعلة التي تحدد الأحداث ، والأحداث التي تحدد الجهات الفاعلة.

غالبًا ما يكون كل ما نعرفه عن الممثلين والأحداث هو حضور مشترك بسيط. هذا يعني أن أحد الممثلين كان أو لم يكن حاضرًا ، ومصفوفة الوقوع لدينا ثنائية. في مثل هذه الحالات ، يمكن تطبيق طرق القياس التي تمت مناقشتها أعلاه ، ولكن يجب توخي الحذر الشديد بشأن النتائج. وذلك لأن طرق الأبعاد المختلفة تعمل على مصفوفات التشابه / المسافة ، ويمكن أن تكون القياسات مثل الارتباطات (كما هو مستخدم في تحليل عامل الوضعين) مضللة مع البيانات الثنائية. حتى تحليل المراسلات ، وهو أكثر ملاءمة للبيانات الثنائية ، يمكن أن يكون مزعجًا عندما تكون البيانات متفرقة.

نهج بديل هو نمذجة الكتلة. تعمل نمذجة الكتل مباشرةً على مصفوفة الحدوث الثنائي من خلال محاولة تبديل الصفوف والأعمدة لتلائم الصور المثالية قدر الإمكان. لا يتضمن هذا النهج أيًا من افتراضات التوزيع التي يتم إجراؤها في تحليل القياس.

من حيث المبدأ ، يمكن للمرء أن يلائم أي نوع من النماذج الكتلية لبيانات حدوث كل حدث على حدة. سوف ندرس نموذجين يطرحان أسئلة (بديلة) ذات مغزى حول أنماط الارتباط بين الفاعلين والأحداث. يمكن حساب كلا النموذجين مباشرة في UCINET. نماذج الكتل البديلة ، بالطبع ، يمكن أن تكون مناسبة لبيانات الوقوع باستخدام خوارزميات النمذجة الكتلية الأكثر عمومية.

جدول المحتويات تحليل محيطي مركزي ثنائي الوضع

هيكل المحيط الأساسي هو نمط نموذجي مثالي يقسم الصفوف والأعمدة إلى فئتين. إحدى الكتل الموجودة على القطر الرئيسي (اللب) عبارة عن كتلة عالية الكثافة والكتلة الأخرى على القطر الرئيسي (المحيط) عبارة عن كتلة منخفضة الكثافة. نموذج محيط النواة غير مبال بكثافة الروابط في الكتل غير القطرية.

عندما نطبق نموذج المحيط الأساسي على بيانات الفاعل تلو الآخر (انظر الشبكة و gtCore / Periphery ) ، يسعى النموذج إلى تحديد مجموعة من الممثلين الذين لديهم كثافة عالية من الروابط فيما بينهم (النواة) من خلال مشاركة العديد من الأحداث المشتركة ، ومجموعة أخرى من الجهات الفاعلة التي لديها كثافة منخفضة جدًا من الروابط فيما بينها (المحيط) من خلال وجود عدد قليل من الأحداث المشتركة. الفاعلون في الجوهر قادرون على تنسيق أفعالهم ، لكن أولئك الموجودين في الأطراف ليسوا كذلك. نتيجة لذلك ، يتمتع الفاعلون في الجوهر بميزة هيكلية في علاقات التبادل مع الجهات الفاعلة في الأطراف.

عندما نطبق نموذج المحيط الأساسي على بيانات الفاعل على حدة ( الشبكة و gt2-Mode & gtCategorical Core / Periphery ) نسعى إلى الحصول على نفس الحجم المثالي & & quot؛ & quot؛ من كتلة عالية ومنخفضة الكثافة على طول القطر الرئيسي. لكن المعنى الآن مختلف نوعًا ما.

تتكون العلامة & quotcore & quot من قسم من الممثلين المرتبطين ارتباطًا وثيقًا بكل حدث في قسم الحدث وفي نفس الوقت قسم للأحداث المرتبطة ارتباطًا وثيقًا بالجهات الفاعلة في القسم الأساسي. لذا ، فإن & quotcore & quot عبارة عن مجموعة من الجهات الفاعلة المتزامنة بشكل متكرر و الأحداث. يتكون & quotperiphery & quot من قسم من الممثلين الذين لم يشاركوا في الحادث نفسه وتقسيم الأحداث المنفصلة لأنه لا يوجد بينهم ممثلون مشتركون.

الشبكة و gt2-Mode & gtCategorical Core / Periphery يستخدم الأساليب العددية للبحث عن تقسيم الممثلين والأحداث التي تقترب قدر الإمكان من الصورة المثالية. يوضح الشكل 17.16 جزءًا من نتائج تطبيق هذه الطريقة على المشاركة (وليس التحزب) في بيانات الجهات المانحة والمبادرات في كاليفورنيا.

الشكل 17.16 نموذج الأطراف الأساسية الفئوية لمانحين بمليون دولار في كاليفورنيا ومبادرات الاقتراع (مبتورة)

طريقة البحث العددي المستخدمة من قبل الشبكة و gt2-Mode & gtCategorical Core / Periphery هي خوارزمية وراثية ، ويتم تحديد مقياس جودة الملاءمة من حيث & quot؛ درجة لياقة & quot (0 تعني عدم الملائمة ، 1 تعني ملاءمة ممتازة). يمكنك أيضًا الحكم على جودة النتيجة من خلال فحص مصفوفة الكثافة في نهاية الإخراج. إذا كان نموذج الكتلة ناجحًا تمامًا ، يجب أن يكون للكتلة 1،1 كثافة واحدة ، ويجب أن يكون للكتلة 2 ، 2 كثافة صفرية. على الرغم من أن النموذج هنا بعيد عن الكمال ، إلا أنه جيد بما يكفي لأخذها على محمل الجد.

تُظهر المصفوفة المحظورة & quotor & quot؛ المكونة من الحزب الديمقراطي ، وعدد من النقابات الكبرى ، ورابطة صناعة البناء الذين من المرجح جدًا أن يشاركوا جميعًا في عدد كبير من المبادرات (الاقتراح 23 من خلال الاقتراح 18). يتم تجميع ما تبقى من الجهات الفاعلة في الأطراف حيث يشارك كلاهما بشكل أقل تواترا ، ولديهما القليل من القضايا المشتركة. يتم أيضًا تصنيف عدد كبير من القضايا على أنها & quot ؛ هامشية & quot ؛ بمعنى أنها تجتذب عددًا قليلاً من المانحين ، وليس لدى هؤلاء المانحين سوى القليل من القواسم المشتركة. نرى أيضًا (أعلى اليمين) أن الفاعلين الأساسيين يشاركون إلى حد ما (.179) في القضايا الهامشية. في أسفل اليسار ، نرى أن الجهات الفاعلة المحيطية تشارك بشكل أكبر إلى حد ما (.260) في القضايا الجوهرية.

جدول المحتويات تحليل الفصائل ثنائية الوضع

نموذج الكتلة البديل هو & quot ؛ & quot ؛ & quot ؛ الفصائل & quot ؛ وهي تجمعات ذات كثافة عالية داخل المجموعة ، وكثافة منخفضة للعلاقات بين المجموعات. الشبكات و gtSubgroups & gtFactions يناسب نموذج الكتلة هذا لبيانات أحادية النمط (لأي عدد من الفصائل يحدده المستخدم). الشبكة وفصائل gt2-Mode و gt2-Mode يناسب نفس النوع من النموذج لبيانات ثنائية الوضع (ولكن لفصيلين فقط).

عندما نطبق نموذج الفصائل على بيانات الفاعل ذات النمط الواحد ، فإننا نحاول تحديد مجموعتين من الممثلين المرتبطين ارتباطًا وثيقًا ببعضهم البعض من خلال حضور جميع الأحداث نفسها ، ولكنهم غير مرتبطين بشكل كبير بأعضاء الفصائل الأخرى والأحداث التي اربطهم ببعضهم البعض. إذا أردنا تطبيق فكرة الفصائل على الأحداث في تحليل أحادي النمط ، فسنسعى لتحديد الأحداث التي كانت مرتبطة ارتباطًا وثيقًا من خلال وجود نفس المشاركين بالضبط.

الشبكة وفصائل gt2-Mode و gt2-Mode يطبق نفس الأسلوب على المصفوفة المستطيلة لكل حدث على حدة. من خلال القيام بذلك ، نحاول تحديد التجمعات المشتركة للجهات الفاعلة والأحداث التي تكون متنافية قدر الإمكان. من حيث المبدأ ، يمكن أن يكون هناك أكثر من فصيلين من هذا القبيل. يوضح الشكل 17.17 نتائج نموذج الفصائل ثنائية النمط لمشاركة كبار المانحين في المبادرات السياسية.

الشكل 17.17. نموذج فصيلين في كاليفورنيا بمليون دولار من المتبرعين ومبادرات الاقتراع (مبتورة)

يتوفر مقياسان لجودة الملاءمة. أولاً ، لدينا علامة & quotfitness & quot الخاصة بنا ، وهي الارتباط بين الدرجات الملحوظة (0 أو 1) والنتائج التي & quot؛ يجب & quot أن تكون موجودة في كل كتلة. تخبرنا الكثافة في الكتل أيضًا عن جودة الملاءمة. لتحليل الفصائل ، سيكون النمط المثالي عبارة عن كتل كثيفة من 1 على طول القطر (العديد من الروابط داخل المجموعات) وكتل صفرية من القطر (الروابط بين المجموعات).

إن ملاءمة نموذج الفصيلين ليس مثيرًا للإعجاب مثل ملاءمة نموذج المحيط الأساسي. يشير هذا إلى أن & quotimage & quot في سياسة كاليفورنيا كواحد من فضاءين منفصلين ومفككين إلى حد كبير لممثلي المشكلة ليس مفيدًا مثل صورة مركز عالي الكثافة للفاعلين والقضايا المقترنة بمجموعة منفصلة من القضايا والمشاركين.

كما أن الحظر نفسه ليس جذابًا للغاية ، حيث يضع معظم الممثلين في فصيل واحد (بكثافة متواضعة تبلغ 401). الفصيل الثاني صغير ، وله كثافة (.299) لا تختلف كثيرًا عن الكتل خارج القطر. كما كان من قبل ، فإن منع الممثلين من قبل الأحداث هو تجميع مجموعات من الممثلين والأحداث التي تحدد بعضها البعض.

أحد الموضوعات الرئيسية المستمرة لتحليل الشبكات الاجتماعية هو الطريقة التي يقوم بها الفاعلون الفرديون & amp ؛ يقتبس & quot ؛ هياكل اجتماعية أكبر من خلال أنماط تفاعلهم بينما ، في نفس الوقت، تشكل الأنماط المؤسسية الاختيارات التي يتخذها الأفراد المنضمون داخل الهياكل.

تقدم البيانات ذات الوضعين (يشار إليها غالبًا باسم & quotactor-by-Event & quot أو & quot ؛ الانتماء & quot في تحليل الشبكة الاجتماعية) بعض الاحتمالات المثيرة للاهتمام لاكتساب رؤى حول العلاقات الكلية والجزئية أو هيكل الوكيل. باستخدام البيانات ذات الوضعين ، يمكننا فحص كيفية تشكيل الهياكل الكلية (الأحداث) للتفاعلات بين الوكلاء (أو لا) يمكننا أيضًا فحص كيفية تحديد الجهات الفاعلة وإنشاء الهياكل الكلية من خلال أنماط ارتباطها بها. بالإضافة إلى ذلك ، يمكننا محاولة وصف أنماط العلاقات بين الجهات الفاعلة والهياكل في وقت واحد.

في هذا الفصل ، درسنا بإيجاز بعض الطرق النموذجية التي تظهر بها البيانات ذات الوضعين في تحليل الشبكة الاجتماعية ، وهياكل البيانات المستخدمة لتسجيل ومعالجة البيانات ذات الوضعين. لقد درسنا أيضًا بإيجاز فائدة الرسوم البيانية ثنائية الوضع (الرسوم البيانية ثنائية المستوى) في تصور & quotsocial space & quot المحددة من قبل كل من الممثلين والأحداث.

على الرغم من ذلك ، كان اهتمامنا الأساسي على طرق محاولة تحديد الأنماط في البيانات ذات الوضعين التي قد تساعدنا بشكل أفضل في وصف وفهم سبب ملاءمة الممثلين والأحداث معًا & quot ؛ بالطرق التي يفعلونها.

فئة واحدة من الأساليب مستمدة من تحليل العوامل والنهج ذات الصلة. تسعى هذه الأساليب (أفضل تطبيق على البيانات ذات القيمة) إلى تحديد & quotdimensions & quot الكامنة في مساحة الحدث الممثل ، وتعيينهم لكل من الممثلين والأحداث في هذا الفضاء. يمكن أن تكون هذه الأساليب مفيدة بشكل خاص في البحث عن & quothidden logic & quot أو & quot ؛ بنية & quot ؛ لأبعاد أكثر تجريدية قد تكمن وراء تفاعلات العديد من الجهات الفاعلة المحددة عبر العديد من الأحداث المحددة. يمكن أن تكون مفيدة أيضًا في تحديد مجموعات الممثلين والأحداث التي & quot؛ تتجمع معًا & quot عند عرضها من خلال عدسة الأبعاد المجردة الكامنة.

فئة أخرى من الأساليب تعتمد على نمذجة الكتلة. الهدف من هذه الأساليب هو تقييم مدى ملاءمة الأنماط المرصودة لانتماءات الحدث الفاعل مع بعض المفاهيم السابقة لطبيعة & quot مشتركة الفضاء & quot (على سبيل المثال & quotcore-periphery & quot أو & quotfactions & quot). إلى الحد الذي يمكن فيه التفكير في ارتباطات حدث الممثل بشكل مفيد بهذه الطرق ، تسمح لنا نماذج الكتلة أيضًا بتصنيف أنواع أو مجموعات من الممثلين إلى جانب الأحداث التي تميزهم.

لا يلزم أن يقتصر التحليل ثنائي الوضع للشبكات الاجتماعية على الأفراد ومشاركتهم في الأنشطة التطوعية (كما في حالات الأمثلة لدينا ، ودراسة ديفيس الأصلية التي نوقشت في بداية هذا الفصل). يمكن تطبيق أدوات التحليل ثنائي الوضع على بيانات CSS (البنية الاجتماعية المعرفية) لمعرفة ما إذا كان يمكن تصنيف المدركين وفقًا للتشابه في تصوراتهم للشبكات ، بالتزامن مع تصنيف صور الشبكة من حيث تشابه أولئك الذين يقومون بالإدراك. قد يُنظر إلى الوحدات على أي مستوى من مستويات التحليل (المنظمات والصناعات والدول القومية والحضارات ، وما إلى ذلك) بشكل مفيد على أنها مشاكل ثنائية النمط.


17.4: التحليل الكمي

يتم توفير جميع المقالات المنشورة بواسطة MDPI على الفور في جميع أنحاء العالم بموجب ترخيص وصول مفتوح. لا يلزم الحصول على إذن خاص لإعادة استخدام كل أو جزء من المقالة المنشورة بواسطة MDPI ، بما في ذلك الأشكال والجداول. بالنسبة للمقالات المنشورة بموجب ترخيص Creative Common CC BY ذي الوصول المفتوح ، يجوز إعادة استخدام أي جزء من المقالة دون إذن بشرط الاستشهاد بالمقال الأصلي بوضوح.

تمثل الأوراق الرئيسية أكثر الأبحاث تقدمًا مع إمكانات كبيرة للتأثير الكبير في هذا المجال. يتم تقديم الأوراق الرئيسية بناءً على دعوة فردية أو توصية من المحررين العلميين وتخضع لمراجعة الأقران قبل النشر.

يمكن أن تكون ورقة الميزات إما مقالة بحثية أصلية ، أو دراسة بحثية جديدة جوهرية غالبًا ما تتضمن العديد من التقنيات أو المناهج ، أو ورقة مراجعة شاملة مع تحديثات موجزة ودقيقة عن آخر التقدم في المجال الذي يراجع بشكل منهجي التطورات الأكثر إثارة في العلم. المؤلفات. يوفر هذا النوع من الأوراق نظرة عامة على الاتجاهات المستقبلية للبحث أو التطبيقات الممكنة.

تستند مقالات اختيار المحرر على توصيات المحررين العلميين لمجلات MDPI من جميع أنحاء العالم. يختار المحررون عددًا صغيرًا من المقالات المنشورة مؤخرًا في المجلة والتي يعتقدون أنها ستكون مثيرة للاهتمام بشكل خاص للمؤلفين أو مهمة في هذا المجال. الهدف هو تقديم لمحة سريعة عن بعض الأعمال الأكثر إثارة المنشورة في مجالات البحث المختلفة بالمجلة.


شاهد الفيديو: اقوى طريقة لتحديد مناطق صانع السوق بمنظومة السيولة Cumulative system (شهر اكتوبر 2021).